Descripción del proyecto
El papel de las redes de regulación génica en la ingeniería celular de alta precisión
Las células humanas modificadas y cultivadas en el laboratorio han mejorado notablemente nuestra capacidad para modelizar la biología y las enfermedades humanas. Sin embargo, los análisis transcriptómicos de célula única revelan que estas células a menudo difieren de las células presentes en el cuerpo humano. La falta de comprensión de las redes de regulación génica (GRN, por sus siglas en inglés) que determinan la identidad celular dificulta el desarrollo de una ingeniería celular precisa. En el proyecto DECIPHER, financiado por el Consejo Europeo de Investigación, se pretende abordar este reto descifrando las GRN mediante tecnologías avanzadas de análisis de célula única. El equipo del proyecto convertirá células madre pluripotentes inducidas humanas en subtipos neuronales y gliales específicos y estudiará cómo interactúan estas células en un entorno pluricelular. Al revelar cómo las GRN controlan la identidad celular y favorecen la maduración, el objetivo de DECIPHER es posibilitar una ingeniería más precisa de las células humanas para la modelización de enfermedades, la terapia celular y la medicina regenerativa.
Objetivo
Human cells engineered in vitro have revolutionized our ability to model human biology and diseases, offering exciting opportunities for therapeutic screening and intervention. However, single-cell transcriptomics (scRNA-seq) reveals that engineered cells often remain heterogeneous, immature, and dissimilar to primary counterparts. Precise cell engineering remains challenging without systematic interrogation of gene regulatory networks (GRNs) that establish cell identity. Here, we propose to engineer precise cell fates and states by coupling GRN decoding, perturbation screening, and single-cell technologies. Our vision is to decode GRNs that shape cell identities in fate specification, multicellular communication, and maturation, and use this insight to 1) engineer precise cell subtypes, 2) reconstruct niche-specific signatures, and 3) accelerate maturation. Using human induced pluripotent stem cell (iPSC)-derived neural cells, we will first couple combinatorial transcription factor screening with scRNA-seq to directly induce iPSCs into specific neuron subtypes guided by primary neuron GRNs. Second, we will program glial cell subtypes and reconstruct multi-cellular niche with neurons, analyze how niche cross-talk impacts cell fates and states, and use emerged GRNs to engineer niche-specific signatures. Finally, we will decode dynamic GRNs during neural maturation and screen for determinants to accelerate maturation. DECIPHER aims to dissect the causal links between GRNs and cell identities, offering mechanistic insights into drivers of cell identity changes with the ambitious goals to engineer precise and mature cell subtypes for disease modeling, cell therapy, and regenerative medicine. Our approach holds great potential to study diverse cell fate and state transition events, such as development, reprogramming, regeneration, and cancer. The perturbation atlas generated here will empower AI-driven predictive modelling to guide future cell engineering.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo.
La clasificación de este proyecto ha sido validada por personas.
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo.
La clasificación de este proyecto ha sido validada por personas.
Palabras clave
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
PROGRAMA PRINCIPAL
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Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
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Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
(se abrirá en una nueva ventana) ERC-2025-STG
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Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.
08003 Barcelona
España
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.