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Lateral Gene Transfer: Genomic Recruitment, Integration, and Persistence

Descripción del proyecto

La transferencia génica oculta en la evolución de las plantas

La evolución suele producirse mediante la herencia genética vertical, es decir, de progenitores y descendiente. Sin embargo, las plantas pueden adquirir genes de especies no emparentadas gracias a la transferencia genética horizontal (LGT, por sus siglas en inglés). El proyecto LGT-GRIP, financiado por las acciones Marie Skłodowska-Curie, tiene como objetivo cuantificar la frecuencia con la que se produce la LGT en las plantas y qué ocurre con esos genes una vez incorporados al genoma. Mediante la secuenciación de miles de individuos de una especie de gramínea silvestre, se estudiará la frecuencia de los genes transferidos y su persistencia en las poblaciones naturales. También se analizará la relación entre las características de estos genes y su permanencia o desaparición, así como los posibles beneficios que aportan. En conjunto, se determinará la relación entre los atributos genéticos y su destino dentro del genoma vegetal.

Objetivo

Evolution usually proceeds through vertical inheritance, where genetic information is transmitted from parents to offspring and gradually altered by mutation and recombination. Organisms can also occasionally acquire new genes directly from other species through lateral gene transfer (LGT). In bacteria, this process is a major evolutionary force, yet in plants it is still poorly understood. Striking examples show that they can acquire entire genes from distant relatives, sometimes gaining important functions. However, most of what we know comes from isolated case studies, and we still lack a quantitative framework to explain how often LGT happens and which factors determine whether foreign genes persist or disappear. The goal of this project is to estimate the true rate and fitness effects of LGT insertions. I will sequence thousands of individuals from a wild grass known to have acquired foreign genes and track how frequently each transferred gene is found in natural populations. Using pangenomics, I will integrate those frequencies with different features of the transferred fragments to explain variance in gene acquisition and retention. This project will provide the first quantitative estimates of how frequent, harmful, or beneficial LGTs are in plant populations, and identify the conditions that make foreign genes succeed. This will transform our understanding of LGT as a predictable evolutionary process with direct implications for plant evolution, crop improvement, and biotechnology.

Ámbito científico (EuroSciVoc)

Programa(s)

Tema(s)

Régimen de financiación

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

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Convocatoria de propuestas

(se abrirá en una nueva ventana) HORIZON-MSCA-2025-PF

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Coordinador

THE UNIVERSITY OF SHEFFIELD
Aportación neta de la UEn
€ 260 347,92
Dirección
FIRTH COURT WESTERN BANK
S10 2TN SHEFFIELD
Reino Unido
Región
Yorkshire and the Humber South Yorkshire Sheffield
Tipo de actividad
Higher or Secondary Education Establishments
Enlaces
Coste total
Sin datos