Description du projet
Un modèle de fondation spécifique à l'intestin pour comprendre le développement intestinal et la pathogenèse
Le volume croissant de données biologiques multimodales ouvre de nouvelles perspectives pour les modèles informatiques, qui permettent d’approfondir notre compréhension des processus complexes liés au développement et aux maladies. Les modèles de fondation se sont imposés comme de puissants outils pour l’apprentissage de représentations biologiques transférables d’un système biologique à l’autre. Soutenu par le programme Actions Marie Skłodowska-Curie, le projet DELIGHT-FM va développer le premier modèle de fondation spécifique à l’intestin qui tient compte du développement, en intégrant des informations transcriptomiques, épigénomiques et spatiales afin de mettre au jour les programmes moléculaires régissant la maturation intestinale et les pathologies. En appliquant ce cadre au développement sain et aux tissus de nourrissons prématurés, DELIGHT-FM entend révéler les mécanismes sous-jacents à la tolérance immunitaire, identifier les vulnérabilités développementales, accélérer la découverte de biomarqueurs et de traitements pour les maladies intestinales néonatales, et proposer une ressource réutilisable pour l’ensemble de la communauté scientifique.
Objectif
With this fellowship, I will leverage recent advances in foundation modelling and unique multimodal single-cell and spatial datasets to develop DELIGHT-FM, the first gut-specific, multimodal, and developmentally aware foundation model. Unlike existing generalist approaches, DELIGHT-FM will explicitly capture intestinal tissue architecture, evolving niches, and immune colonization across developmental stages, transforming descriptive atlases into predictive, mechanistic insights. The project has three objectives: (i) build and validate a biology-first gut foundation model integrating transcriptomic, epigenomic, and spatial modalities; (ii) use model-derived features to define how mucosal tolerance is imprinted during healthy development; and (iii) apply in silico perturbations to identify disrupted trajectories in preterm infants and predict the minimal molecular or spatial changes needed to restore immune balance. This pioneering approach will provide the first holistic framework of human intestinal immune maturation, establish new strategies for biomarker and therapeutic discovery in neonatal disease, and deliver an open, reusable foundation model resource for the community. Through this fellowship, I will gain access to cutting-edge foundation model expertise in the Mahmood group, alongside comprehensive single-cell datasets and workflows in the Simmons and Antanaviciute groups, advancing both gut biology and digital medicine with broad implications for neonatal health, precision medicine, and the next generation of AI-driven biology.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-GF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - Global Fellowships
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) HORIZON-MSCA-2025-PF
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
OX1 2JD Oxford
Royaume-Uni
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.