Objetivo
Programmable nucleases such as CRISPR-Cas12 open an important window for understanding microbial defense. Nucleases like Cas12 rely on an RNA guide’s (gRNA) sequence to direct it towards specific DNAs – typically those derived from previously-encountered mobile genetic elements (MGEs), like phages. Features – such as how fast they operate on DNA targets, or how well they distinguish gRNA-matched DNA from partially matched DNA (specificity) – can tell us a lot about the environments they operate in, the MGEs they face, and even how well we can expect them to operate in new genomes. We lack complete understanding of these features, these complex phenotypes, like specificity. How does gRNA programming distinguish each nuclease’s potential targets? Current methods, both genome-wide assays and computational predictions, are context-dependent, often obscuring nuclease-intrinsic features. As a result, specificity remains too complex to predict from nuclease sequence alone. This could be possible with an appropriate high-throughput strategy, especially one that leverages nucleases’ natural diversity to indicate how their features change across evolution. The Seq2Cut project seeks to uncover the evolutionary basis of the key nuclease features such as specificity and establish a comparative framework for understanding how nuclease function evolves. Seq2Cut will overcome current limitations with high-throughput methods that integrate biochemistry, computation, bioinformatics, and engineering to generate standardized, comparable datasets across a diverse set of Cas12 proteins. By combining experimental measurements with computational modeling, I aim to uncover how critical nuclease features have evolved, mapping these functions to their protein sequence and structure. Under the supervision of Dr. Stephen Jones who has vast experience in employing these technologies, I anticipate making fundamental advances in our understanding and biotechnology uses for CRISPR in genome editing
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales ciencias biológicas microbiología virología
- ciencias naturales ciencias biológicas genética ADN
- ciencias naturales ciencias biológicas bioquímica biomoléculas proteínas
- ciencias naturales ciencias biológicas genética ARN
- ciencias naturales ciencias biológicas genética genoma
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Palabras clave
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
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HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
PROGRAMA PRINCIPAL
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Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
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Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
(se abrirá en una nueva ventana) HORIZON-MSCA-2025-PF
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Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.
01513 Vilnius
Lituania
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.