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Contenu archivé le 2024-05-29

Substrate specificity analysis as a key to disclose physiological roles of rhomboid intramembrane proteases.

Objectif

The rhomboids are intramembrane proteases recently discovered in Drosophila where they cleave several growth factors within their transmembrane domains (TMDs) enabling thus their secretion. Rhomboids are conserved across evolution, but their physiological functions remain largely unknown. An efficient method for revealing rhomboid functions is the identification of their substrates. To achieve this goal, I propose two complementary approaches and describe their application to prokaryotic and eukaryotic rhom boids. The first approach relies on a library of chimeric substrates derived from predicted single-TMD proteins from Bacillus subtilis. The library will be screened against B. subtilis rhomboids and mouse rhomboid RHBDL2 in a heterologous cell-based assay. This approach should identify B. subtilis rhomboid substrates and provide insight into the TMD determinants of a rhomboid substrate. The second approach consists in identification of proteins released into the medium by the expression of rhomboid. Extrace llular protein profiles of cell lines expressing either active rhomboid or an inactive rhomboid mutant will be compared and relative protein abundances will be quantified by proteomic methods based on two-dimensional liquid chromatography and mass spectrom etry. This approach has the potential to provide a generic technology for identification of rhomboid substrates, which would have a major impact on the field.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.

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Mots‑clés

Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).

Thème(s)

Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.

Appel à propositions

Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.

FP6-2002-MOBILITY-5
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Régime de financement

Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.

EIF - Marie Curie actions-Intra-European Fellowships

Coordinateur

MEDICAL RESEARCH COUNCIL
Contribution de l’UE
Aucune donnée
Coût total

Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.

Aucune donnée
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