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Contenu archivé le 2024-05-29

Functional comparative Genomics and loss of function study of Vertebrate Iroquois A Genes

Objectif

The Iroquois (Irx) genes participate in numerous events during vertebrate neural development, such as antero-posterior and dorso-ventral subdivision of the developing nervous system. However, most of the information about their function and regulation still remains unknown.

Mammalian Irx genes are arranged in two clusters, IrxA and IrxB, containing three genes each. To understand the role of Irx during development it is imperative to unravel the regulatory networks in which these clustered genes are immerse d. Dr. Gómez-Skarmeta group (CABD, Seville) has taken advantage of the availability of whole genome sequences for a number of vertebrate model systems to identify putative enhancers within the Irx clusters.

By using evolutionary conservation as a guide for important genomic sequences, they have found many conserved non-coding regions located along both Irx clusters (unpublished data). I wish to incorporate to his group and focus in the study of function and regulation of the Iroquois A cluster.

The purpose of this project is:
- To examine whether the conserved regions harbour specific enhancers in vertebrates (mouse, Xenopus, zebrafish) using genomic comparison and generating transgenic animals with these regions;
- To characterize the regulatory and signalling pathways that act on some of these enhancers in different vertebrates by a combination of different biological disciplines and techniques (bioinformatics, animal cap, dominant negative forms);
- To explore the defects associated with loss of function of single, or combinations of, Irx genes using morpholinos in Xenopus tropicalis.

Additionally, in the next future, we will determine whether these elements and the pathways that activate them can be used to differentiate mouse stem cells towards specific neural fates. The study of IrxA function in different vertebrates may help to understand the development of the neural system and of certain human diseases (e.g. cri-du-chat syndrome).

Champ scientifique (EuroSciVoc)

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Thème(s)

Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.

Appel à propositions

Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.

FP6-2002-MOBILITY-11
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Régime de financement

Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.

ERG - Marie Curie actions-European Re-integration Grants

Coordinateur

CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGACIONES CIENTIFICAS
Contribution de l’UE
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Coût total

Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.

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