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CORDIS - Résultats de la recherche de l’UE
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Contenu archivé le 2024-06-16

Development of a complete integrated SNP analysis system

Objectif

The requirement to screen for known SNPs (single nucleotide polymorphisms) has become one of the key challenges to be addressed to enable the exploitation of the human genome sequence, where approximately 3 million SNPs are responsible for all of the variation within the human population. Several methods and technologies are currently available for detection of SNPs, but no single platform exists which can deliver 100% accuracy, in a low cost, versatile, and easy-to-use integrated system.

The proposed research will focus on the development of integrated SNP detection platforms to include modules for DNA extraction and purification from biological samples, DNA amplification, DNA characterisation (including SNP detection), signal transduction, interpretation and data analysis. Integration of the modules on a single platform will include a transport mechanism based on electrowetting actuation (EWOD).

Two alternatives SNP detection platforms will be developed based on optical and magnetic sensing respectively. The whole system will be packaged as a single automated functional system with a simplified GUI interface, based on specifications recommended by potential end-users within the consortium. This systems development will focus on delivering a product customised for low to medium throughput, low cost, point-of-care applications, with emphasis on providing very rapid and accurate results.

Within the project, the systems will be benchmarked for screening of SNPs in the CFTR gene that are associated with cystic fibrosis. CF patient samples will be used to verify the accuracy and reproducibility of the system in a clinical diagnostics laboratory.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.

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Mots‑clés

Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).

Thème(s)

Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.

Appel à propositions

Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.

FP6-2004-IST-NMP-2
Voir d’autres projets de cet appel

Régime de financement

Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.

STREP - Specific Targeted Research Project

Coordinateur

UNIVERSITY COLLEGE CORK, NATIONAL UNIVERSITY OF IRELAND, CORK
Contribution de l’UE
Aucune donnée
Coût total

Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.

Aucune donnée

Participants (6)

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