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CORDIS - Resultados de investigaciones de la UE
CORDIS
Contenido archivado el 2024-06-18

Incorporating protein backbone flexibility and induced-fit in drug discovery

Objetivo

The activity of many proteins, strongly changes when small ligands dock into well defined cavities of the protein receptor. For proteins involved in disease-related metabolic pathways novel artificial ligands may act as drugs. In the drug discovery process, high-throughput in-silico screening(IS-HTS) methods are increasingly used to identify lead compounds, i.e. ligands that bind to a target protein with high affinity. Existing methods have significant shortcomings, because the time spent on each ligand is very short. In an ongoing collaboration with the Barcelona Supercomputer Center (BSC) I implemented FlexScreen, the IS-HTS program developed by the host group at FZK, on the Cell, a new processor developed by BSC and IBM into the next generation of ultra-fast peta-flop supercomputers. The individual processing unit of these new computers is distributed separately and delivers about 250 times the performance of a PC at roughly the same cost. In the mobility project I will exploit this unprecedented computational power to incorporate new ideas into the IS-HTS method, not achievable with standard computational hardware. Continuing the collaboration with BSC I will develop improved biophysical scoring functions and novel docking strategies. I will also address a long-standing problem of IS-HTS methods: the change of protein conformation upon binding (induced fit). In collaboration with the cancer research center in Heidelberg (DKFZ) I will apply these new methods to search for new lead compounds to DNA-methyl-transferases to develop new therapies for cancer. The results of this research will reduce the time and cost of the initial stages of drug design, not only in academic but also for industrial projects, increasing the competitiveness of the European pharmaceutical industry. They will improve the quality of life of the European population by helping to discover new drug molecular scaffolds, addressing one of the main problems of present-day drug development.

Ámbito científico (EuroSciVoc)

CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..

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Palabras clave

Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).

Programa(s)

Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.

Tema(s)

Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.

Convocatoria de propuestas

Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.

FP7-PEOPLE-2007-2-1-IEF
Consulte otros proyectos de esta convocatoria

Régimen de financiación

Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.

MC-IEF - Intra-European Fellowships (IEF)

Coordinador

KARLSRUHER INSTITUT FUER TECHNOLOGIE
Aportación de la UE
€ 159 828,87
Dirección
KAISERSTRASSE 12
76131 Karlsruhe
Alemania

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Región
Baden-Württemberg Karlsruhe Karlsruhe, Stadtkreis
Tipo de actividad
Higher or Secondary Education Establishments
Enlaces
Coste total

Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.

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