Objectif
Global systems for biomedical research, GlobalBioRes, is a multidisciplinary project in computing science and bioinformatics. It will enable automated data integration from web databases and develop new visualizations supporting the understanding of complex biomedical data sets.
Researchers using post-genomic technologies perform large-scale experiments, which can only be interpreted in the light of data harvested from many web databases. Although data harvesting can be automated, automated removal of duplicate values and data merging are not supported, and are not possible with current database technologies.
There are also no adequate visualization tools to offer the combined analysis of textual data sets and the physical framework of genomes and chromosomes. The project will develop and test data mining algorithms on around 15 biological databases available in XML.
As the schemas are dissimilar, data mining will apply to data values indexed in a relational database identify mappings between dissimilar XML subtrees, based on data mining results Record those mappings as tree subsumptions, and index them Develop and test algorithms which use subsumptions to remove duplicated data values and merge the data trees visualize integrated data in the context of genome and synteny maps.
Iteratively test both data integration and visualization approaches, in order to develop new insights on what mechanisms are effective in data integration and visualization. The proposed system will be tested by our biomedical collaborators in disease gene finding, drug target discovery, and drug delivery research. It is hoped to bring immediate efficiency and quality gains.
In the long term this work will contribute to new technologies for e-Science, e-Business and e-Government, and feed into database technologies. The project will allow the applicant to move abroad to complete her postdoctoral training in collaboration with a recognised research leader.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
- sciences naturelles informatique et science de l'information science des données exploration de données
- sciences médicales et de la santé médecine clinique cardiologie maladies cardiovasculaires
- sciences naturelles sciences biologiques génétique chromosome
- sciences naturelles sciences biologiques génétique génome
- sciences naturelles informatique et science de l'information bases de données base de données relationnelle
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
FP6-2004-MOBILITY-5
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
ZUERICH
Suisse
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.