Objectif
Sendai Virus (SeV) is a prototype of viruses with a negative strand RNA genome. This family of viruses causes important human and animal diseases. RNA synthesis in these viruses requires the placement of the RNA polymerase on the nucleocapsid that assemble s the RNA. This occurs through an interaction between two protein domains: the partly folded PX domain of phosphoprotein P that is part of the polymerase, and the unstructured N-tail domain of nucleocapsid protein N.
For transcribing the template RNA, the polymerase needs to move along the RNA, which requires PX to on and off interact with N-tail domains on subsequent nucleocapsids. This suggests that flexibility is a key issue in the biological function of these domains. This project will study the structure and dynamics of this protein complex by NMR, in order to arrive at a better understanding of the transcription process in this family of viruses. Both PX (partly) and N-tail belong to the class of intrinsically unstructured proteins (IUPs), which encompasses around 25% of all eukaryotic proteins. NMR is one of the sole techniques that are capable of studying this class proteins and this project aims at improving NMR methodology optimised for IUPs.
The project is part of an ongoing collaboration between the host lab and virus group of Prof. R. Ruigrok at the EMBL in Grenoble. This allows me to both acquire skills related to molecular biology as well as to enlarge my knowledge of NMR in order to further develop myself as a bio-molecular NMR spectroscopist. Furthermore, the experiences in NMR application and methodology acquired during my PhD will prove very valuable for the realization of the project.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques microbiologie virologie
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines
- sciences naturelles sciences biologiques génétique ARN
- sciences naturelles sciences biologiques génétique génome
- sciences naturelles sciences biologiques biologie moléculaire
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
FP6-2002-MOBILITY-5
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
France
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.