Objectif
The role of metabolic enzymes in the post-transcriptional control of gene expression is barely explored, with only a few cases deeply studied so far, such as aconitase 1 in iron metabolism or GAIT complex control of pro-inflammatory genes. Here, we propose to identify metabolic enzymes that interact specifically with mRNA by unbiased proteomic and transcriptomic approaches and to investigate their potential roles as gene expression regulators. Metabolic enzymes able to bind mRNAs will be identified by an effective crosslinking method, followed by oligo d(T) isolation and mass spectrometry in both human and yeast systems. Following this first screening, we will select three conserved key metabolic enzymes involved in the regulation of different metabolic pathways for further in depth exploration. Using cross-linking and immunoprecipitation assays followed by deep sequencing, we will identify the specific pool of mRNAs bound to each selected metabolic enzyme. Next, we will determine the RNA motif and the protein domain responsible for the interaction with biochemical and bioinformatic tools. Finally, the effect of overexpression and depletion of these metabolic enzymes in the post-transcriptional control of their target mRNAs will be analyzed. Overall, the proposed project will explore a potential new layer of cell regulation.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques biologie cellulaire métabolisme cellulaire
- sciences naturelles sciences biologiques génétique ARN
- sciences naturelles sciences chimiques chimie analytique spectrométrie de masse
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines enzyme
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
FP7-PEOPLE-2009-IEF
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
69117 Heidelberg
Allemagne
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.