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CORDIS - Résultats de la recherche de l’UE
CORDIS
Contenu archivé le 2024-06-18

International Data Exchange and Data Representation Standards for Proteomics

Objectif

Over the last few years the field of proteomics has evolved into a prolific data producer. As a result, various databases that collect and redistribute the acquired data have been established. While data format standards for quantitative proteomics have now been defined and implemented with significant contribution from the recently completed EU ProDaC grant, standards for quantitative proteomics are still lacking.
This simultaneous creation of multiple repositories and databases, and lack of standards for quantitative proteomics result in a fragmentation of data, and cause confusion for data submitters and users alike.
Based on consortium expertise in the operation of large scale proteomics repositories (PRIDE, PeptideAtlas, Tranche, Peptidome) we aim to implement the next step, regular data exchange between major international proteomics resources. In parallel, we will further develop standards (mzQuantML) for the dynamic field of quantitative mass spectrometry.
The main objectives of ProteomExchange are user-oriented: (i) to provide a single point of data submission to the user; (ii) to ensure data availability in all of the different member databases; (iii) to use community standard formats to represent the data, so it becomes accessible to all regardless of data origin; (iv) to provide added value through different views on the same data, from repositories to derived search tools.
With an international consortium and support from large scale data producers (ISAS (Germany), U. Cambridge (UK), Karolinska Institute (Sweden)), industry (Pfizer, Philips, Waters), and journals (Nature Biotechnology, MCP, JPR), we here propose a Coordination Action project to solidify an emerging informal collaboration between major repositories into a production-quality data deposition and dissemination consortium on par with the systems so successfully employed by three-dimensional structure databases and nucleotide sequence databases, amongst others.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.

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Programme(s)

Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.

Thème(s)

Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.

Appel à propositions

Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.

FP7-HEALTH-2010-single-stage
Voir d’autres projets de cet appel

Régime de financement

Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.

CSA-CA - Coordination (or networking) actions

Coordinateur

EUROPEAN MOLECULAR BIOLOGY LABORATORY
Contribution de l’UE
€ 502 457,00
Adresse
Meyerhofstrasse 1
69117 Heidelberg
Allemagne

Voir sur la carte

Région
Baden-Württemberg Karlsruhe Heidelberg, Stadtkreis
Type d’activité
Research Organisations
Liens
Coût total

Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.

Aucune donnée

Participants (12)

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