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CORDIS - Resultados de investigaciones de la UE
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Contenido archivado el 2024-06-18

A multidisciplinary approach for the computational assembly of large molecular machines from electron density maps

Objetivo

Proteins are often organized in large, dynamic molecular machines. A mechanistic, atomic-resolution understanding of these machines would provide fundamental insights into the clockwork of the complex machinery underlying human life. However, machines such as the 26S-proteasome have resisted crystallization attempts for decades.
Cryo-electron microscopy (cryo-EM) has provided insightful maps of molecular machines, but these lack atomic resolution. In principle, molecular machines can be assembled from atomic homology models of the subunits. However, homology models often contain large errors, causing existing assembly methods to fail.
Here I present a multidisciplinary approach for the assembly of large molecular machines from cryo-EM maps. I will combine computational techniques from cryo-EM, homology modelling and interface prediction into ATTRACT, the only docking method that integrates subunit flexibility into the initial search. Driven by a cryo-EM density map, ATTRACT’s coordinated motions will reduce the initial homology model errors, bending the subunits into the correct shape while they are being assembled.
The challenging nature of the problem requires the integration of approaches. After firm assessment of the abilities of the method, it will be applied to experimental density maps of the proteasome and other molecular machines, providing new fundamental insights when neither complex nor subunits are known.

Ámbito científico (EuroSciVoc)

CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..

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Programa(s)

Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.

Tema(s)

Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.

Convocatoria de propuestas

Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.

FP7-PEOPLE-2010-IEF
Consulte otros proyectos de esta convocatoria

Régimen de financiación

Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.

MC-IEF - Intra-European Fellowships (IEF)

Coordinador

TECHNISCHE UNIVERSITAET MUENCHEN
Aportación de la UE
€ 162 242,40
Dirección
Arcisstrasse 21
80333 Muenchen
Alemania

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Región
Bayern Oberbayern München, Kreisfreie Stadt
Tipo de actividad
Higher or Secondary Education Establishments
Enlaces
Coste total

Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.

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