Objetivo
We propose a technology that will sit at the front-end of sequencing pipelines, present and future, and will significantly enhance the quality and throughput of DNA sequencing.
Although much attention has been given to throughput/cost of the sequencing process itself, the same cannot be said for the preparation of samples. Identified bottlenecks are (1) sequencing technologies require days of upfront sample preparation which is further increased when sequencing selected parts of the genome; (2) genome assembly relies on computationally intensive comparisons to the reference genome because existing technologies produce short sequence reads; (3) it is difficult to begin with small amounts of sample material comprising micro-biopsies and single cells.
The CELL-O-MATIC project will synergize efforts from SMEs, academics and large companies to address these bottlenecks by developing chip-based systems that process DNA from individual cells, ready for next generation high-throughput sequencing.
Single cell analysis has numerous applications in systems biology but we will emphasize DNA isolation and sequencing from circulating tumor cells (CTC), which have a strong prognostic value in cancer management.
A second innovation will be to develop methods that enable up to whole chromosome lengths of DNA to be contiguously mapped using nanofluidics. The inclusion of nanofluidics makes the project particularly distinctive and introduces European SMEs to an area that so far has been the domain of US companies.
A modular prototype comprising, a chip, fluid and thermal control, sonication and optical detection will be developed. Samples prepared using CELL-O-MATIC technology will be benchmarked in a high throughput environment with samples prepared by existing methods. Finally, the information obtained from the CELL-O-MATIC processed sample material will be validated for its utility as an aid to clinical decision making.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales ciencias biológicas genética ADN
- ciencias médicas y de la salud medicina clínica oncología
- ciencias naturales ciencias biológicas genética cromosoma
- ciencias naturales ciencias biológicas genética genoma
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Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
FP7-HEALTH-2011-two-stage
Consulte otros proyectos de esta convocatoria
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Coordinador
2800 Kongens Lyngby
Dinamarca
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.