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CORDIS - Resultados de investigaciones de la UE
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Contenido archivado el 2024-05-30

Reverse engineering of vascular patterning through mosaic in vivo analysis of endothelial cell shape regulation

Objetivo

Current angiogenesis research using genetic loss-of function approaches in mouse and zebrafish models provides for a growing number of genes implicated in blood vessel formation. Mechanistic insight often remains unsatisfactory as phenotypes fall into common categories. Our recent cell competition models combined with computational analysis have transformed the way we can study mechanisms in vascular patterning.

I propose to systematically exploit mosaic analysis in vivo to deconstruct vascular pattern formation in development and disease. Single differentially labelled cells in mouse and zebrafish will be analysed to establish the first catalogue of endothelial cell shapes in reference to the position and developmental phase of the plexus. Dynamic imaging will describe functional shape transitions. Advanced computational analysis of 3D-segmented cell shapes using an optimized set of shape descriptors will be performed to find natural clusters via an unsupervised expectation maximization algorithm. Cross-correlation of shape clusters with gene expression, signalling, oxygen, polarity and cytoskeleton markers will be used to understand how cell shape relates to signalling and local environment. Pharmacological and clonal genetic gain and loss-of-function will be used to analyse dynamic regulation of cell shape leading to altered vascular patterning. Mosaic analysis in retinopathy and tumour models will enable unprecedented resolution to study vascular malformation. Sequential time-lapse imaging in combination with clinical imaging modalities will be used to bridge the gap between experimental and clinical tumour vasculature imaging, enabling us to ask how local environmental changes in the tumour affect blood vessel patterning.

Successful completion of this work will establish the cellular and molecular principles governing vessel remodelling and provide a new conceptual framework and methodology for the analysis of pathological vascular patterning.

Ámbito científico (EuroSciVoc)

CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: https://op.europa.eu/es/web/eu-vocabularies/euroscivoc.

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Tema(s)

Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.

Convocatoria de propuestas

Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.

ERC-2012-StG_20111109
Consulte otros proyectos de esta convocatoria

Régimen de financiación

Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.

ERC-SG - ERC Starting Grant

Institución de acogida

VIB VZW
Aportación de la UE
€ 1 373 503,00
Dirección
SUZANNE TASSIERSTRAAT 1
9052 ZWIJNAARDE - GENT
Bélgica

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Región
Vlaams Gewest Prov. Oost-Vlaanderen Arr. Gent
Tipo de actividad
Research Organisations
Enlaces
Coste total

Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.

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Beneficiarios (1)

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