Objectif
A key question in modern cell biology is how intracellular spatial order is established and maintained. Here, we propose to investigate the physical principles of the formation of intracellular protein patterns, using a multidisciplinary approach that combines quantitative live-cell imaging with computational modeling.
As an in vivo model system we will use fission yeast, which is distinguished by its extraordinarily well-defined shape and intracellular order. In fission yeast, a dynamic microtubule transport system maintains a highly inhomogeneous distribution of the growth-promoting protein tea1. Perturbing the distribution of tea1 leads to severe defects of cell morphology.
We will address the following questions:
- How does the dynamic patterning of tea1 depend on microtubule growth and shrinkage dynamics?
- What is the spatiotemporal accuracy of tea1 pattering?
- How is the transport system affected by cell elongation?
- What are the general differences between protein transports along dynamic as opposed to static microtubules?
We will address these questions using a combination of both experiments and theoretical analysis. Specifically, we will use confocal spinning disc microscopy to measure the time-dependent 3D distribution of fluorescently tagged tea1, tubul in and other relevant proteins.
Based on the data acquired and on existing information, we will formulate a model of tea1 patterning. Predictions following from the model will again be tested experimentally, e.g. using drugs or genetic modifications to perturb the system.
This tight link between theory and experiments will provide novel and comprehensive information on generic properties of microtubule-based transport: a process that is of key relevance to protein patterning in most eukaryotic cells.
During this project, the researcher will receive extensive training in biophysics and computational modeling, thereby significantly broadening his scientific competencies.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences médicales et de la santé biotechnologie médicale génie génétique
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines
- sciences naturelles sciences biologiques biologie cellulaire
- sciences naturelles sciences physiques optique microscopie
- sciences naturelles sciences biologiques biophysique
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
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FP6-2005-MOBILITY-5
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
UTRECHT
Pays-Bas
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.