Objectif
The microbial world remains largely unexplored. The goal of this project is to study microbial genome diversity and understand how the genomes of microbial pathogens evolve, using the alpha-proteobacteria as a model system. The alpha-proteobacteria are a bacterial subdivision of much interest from both a medical and an ecological standpoint.
Many species establish chronic host-infections, with higher vertebrates (e.g. human, cattle and rodents) as well as with plants and insects. Well-known alpha-proteobacterial infections include trench fever, cat-scratch disease (Bartonella sp.) and formation of tumour-like structures in host tissues, such as in plants by Agrobacterium tumefaciens. Moreover, other alpha-proteobacterial species are known to establish tight symbiotic interactions with plants, such as is the case with the formation of root nodules that are involved nitrogen fixation. Furthermore, they represent a genetic group that is predominant in the environment, as suggested by environmental shotgun genome sequencing of the Sargasso Sea.
Because of the broad diversity in genome sizes and structures, the alpha-proteobacteria offer an excellent model system for studies of the forces, mechanisms and rates whereby bacterial genomes evolve. At the date of this writing, more than 20 alpha-proteobacterial genomes have been completely sequenced, ranging in size from 1.1 to 9.1 Megabases, and many more will be available in the near future.
The aim of this project is to study the evolution of the alpha-proteobacteria by analyzing their genomes, and as such gain insight in how specific alpha-proteobacterial lineages have evolved into the present-day pathogens and (endo)symbionts. This will be achieved by reconstructing ancestral alpha-proteobacterial genomes and to specifically study the flow of genes along the nodes towards the different pathogenic and symbiotic lineages, including the ultimate endosymbionts: the eukaryotic mitochondria.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
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FP6-2005-MOBILITY-5
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
UPPSALA
Suède
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.