Objectif
The aim of this proposal is to engineer a synthetic biological network for in vivo regular therapeutic delivery of insulin in a rhythm corresponding to normal nutrient uptake. To this end, we will engineer stable synthetic oscillator networks in yeast and mammalian systems able to express mRNA/protein levels with a pre-determined frequency and amplitude.
The synthetic oscillator network has to guarantee stable and synchronized oscillation in the cell population. The yeast system will be used as a test-bed for the synthetic biology design strategies developed in this project. In the context of the mammalian tissue, individual cellular oscillators have to be synchronized in order to fulfill the macroscopic function of an insulin delivery device. Hence, the engineering of the synthetic network involves additional inputs and outputs that enable resetting of the oscillators.
In view of therapeutic application, the desirable system would reset insulin oscillations synchronously with the circadian rhythm. Specifically, the synthetic oscillator in the mammalian system will be connected to circadian signals like PER1 and CRY. To achieve this aim, COBIOS brings together scientists from yeast and mammalian molecular biology, computer science, engineering and control theory. We will employ methods from systems dynamics and control theory to develop and implement modular control networks that enable oscillations in the networks they will be connected to.
In particular, we will address the problems of
- robustness of controller dynamics,
- suitable interfaces to the controlled networks, and
- mechanisms for regulation of the controller's dynamic characteristics (e.g. period and amplitude) through external signals that can be exogeneous (yeast system) or outputs of cellular signal processing (the circadian clock in mammalian system) at the levels of individual cells and tissues.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques biologie synthétique
- ingénierie et technologie génie électrique, génie électronique, génie de l’information ingénierie électronique traitement des signaux
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines
- sciences naturelles informatique et science de l'information
- sciences naturelles sciences biologiques biologie moléculaire
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
FP6-2005-NEST-PATH
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
ROME
Italie
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.