Objectif
This project aims at importing in Europe key scientific competences developed by the applicant researcher during a period of almost 10 years spent at UC Berkeley (group of Prof. Carlos Bustamante) working on the technique of laser tweezers applied to the study of folding/unfolding pathways of single proteins.
The aforementioned group has pioneered the measurements of the tiny forces which allow a biopolymer to attain and maintain its native structure. Laser tweezers applied to protein folding, have the remarkable advantage of operating on a single molecule, avoiding the ensemble average typical of classical bulky techniques and providing naturally a reaction coordinate to follow the thermodynamic process of folding.
We propose to build the double trap laser tweezers at CNR-INFM-S3 in Modena and to investigate the energy landscape of the folding trajectories of the protein RNaseH by:
- estimating the activation energies between different molecular states along the reaction coordinate from the dependence of the folding rate constants on temperature;
- determining the structures of the transition states through Phi-value analysis;
- analyzing the anisotropy of the energy landscape by denaturing the molecules along different pulling axes, and
- carrying out molecular dynamic simulations to gain insight into the microscopic details of the folding reactions.
The results of these experiments should help elucidating the role of the energy landscape in determining the folding, dynamics and ultimately the function of a protein. The applicant researcher possesses all the needed capabilities to face this ambitious goal.
The host offers in this sense an ideally suited environment for the prompt transplantation and successful development of this technique in Europe. By this action we would import a very novel and unique skill that would foster further development in the field of single biomolecule investigation and nanobiotechnology.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques génétique ADN
- sciences naturelles sciences physiques thermodynamique
- ingénierie et technologie ingénierie des materiaux solides amorphes solides organiques amorphes
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines repliement protéique
- sciences naturelles sciences physiques optique physique des lasers
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
FP6-2004-MOBILITY-12
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
IRG - Marie Curie actions-International re-integration grants
Coordinateur
ROMA
Italie
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.