Objectif
Viruses are extremely abundant in the marine environment and are thought to profoundly influence ecosystem functioning. As host-specific agents of mortality they influence the population dynamics, diversity and evolution of their hosts. However, we are presently unable to assess the abundance or dynamics of discrete viral populations.
Furthermore, estimates of viral-induced mortality are rudimentary at best, due to the lack of appropriate tools to quantify infected host cells. I propose to investigate the diversity of viruses that infect the ecologically important marine cyanobacteria, Synechococcus and Prochlorococcus, as well as assess their impact on host mortality. I will focus on the ubiquitous podoviruses for which little information is presently available. The diversity of cyanobacterial podoviruses will be determined by sequencing the DNA polymerase gene from podovirus isolates.
We will use these findings to develop primers for the specific identification of cyanobacterial podoviruses and will employ a novel molecular approach, solid-phase polymerase chain reaction, for their quantification. The abundance and population dynamics of these podoviruses will then be determined over spatial and temporal scales in the Red Sea and will be compared to host population and total virus dynamics.
Furthermore, this method will be used to amplify viral DNA from single cyanobacterial cells to investigate the extent of podovirus infection. The results from this research will significantly enhance our understanding of the influence of podoviruses on cyanobacterial mortality, population dynamics and community composition, and thus their impact on primary production and recycling of matter in the oceans.
I bring to this project and Europe, unique expertise acquired in the US on physiological, genomic and evolutionary aspects of cyanobacteria-virus interactions. EC funding of this project will advance my progress towards a permanent position at the Technion.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques microbiologie virologie
- sciences naturelles sciences biologiques génétique ADN
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines
- sciences naturelles sciences biologiques écologie écosystème
- sciences naturelles sciences biologiques botanique
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
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FP6-2004-MOBILITY-12
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
IRG - Marie Curie actions-International re-integration grants
Coordinateur
HAIFA
Israël
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.