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CORDIS - Résultats de la recherche de l’UE
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Contenu archivé le 2024-06-16

Genomic fine-mapping of malaria susceptibility loci

Objectif

Malaria due to Plasmodium falciparum kills over a million African children each year. We need to get a better understanding of natural mechanisms of host defence against the parasite, to help in the search for better ways of treating severe malaria and for an effective malaria vaccine. This proposal aims to understand the association between severe malaria and polymorphisms of TNF, the gene encoding tumour necrosis factor. Several different associations have been observed between TNF and severe malaria, but it has not yet been conclusively shown that that the causative polymorphisms are in TNF itself, as opposed to neighbouring genes that are in linkage disequilibrium. The genomic region where TNF is located contains a rich variety of immune genes as well as several poorly understood genes that are suspected to have animmunological function. My goal is to carry out genomic fine-mapping of the region of the human genome around TNF, to determine the causal basis of associations between TNF polymorphisms and susceptibility to severe malaria in African children. I will address two fundamental questions:
(1) Considering a total of 24 genes distributed over a 320kBinterval (from MICA to CLICI) what is the full range of genes that are associated with severe malaria?
(2) Can we narrow down the functional polymorphism(s) responsible for the disease association by a combination of detailed haplotypic analysis and large-scale epidemiological studies in different populations? To address this problem I will begin by defining the haplotypic structure of the 320kb region around TNF in a West African population, and then use the most informative polymorphisms to fine-mapping disease association in large case-control and family-based studied of African children with severe malaria. This project will provide training in human genetic epidemiology, state-of-the-art genotyping technology, genomic informatics and statistical genetics.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.

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Mots‑clés

Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).

Thème(s)

Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.

Appel à propositions

Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.

FP6-2002-MOBILITY-5
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Régime de financement

Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.

EIF - Marie Curie actions-Intra-European Fellowships

Coordinateur

CHANCELLOR, MASTERS AND SCHOLARS OF THE UNIVERSITY OF OXFORD
Contribution de l’UE
Aucune donnée
Adresse
Wellington Square
OXFORD
Royaume-Uni

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Coût total

Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.

Aucune donnée
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