Objetivo
Production of mature mRNA transcripts in vertebrates is regulated at three stages: transcription initiation, splicing and polyadenylation. The combinatorial arrangement of variations at each stage generates, from a single gene, a variety of mRNA isoforms with different start sites, exons or 3' UTRs. Expression of Alternative Transcripts (AT) has been observed to be specific to tissue-type or developmental stage. Disruptions in expression patterns have serious consequences for an organism and are associated with numerous diseases, including cancer, multiple sclerosis, heart failure and neurodegenerative disorders. Identifying disease-specific AT's can lead to development of novel drug targets or markers. European bioinformatics laboratories have contributed to identification of variants of transcript start site, of splicing, and of polyadenylation sites. Our objective here is to develop and integrate these independent approaches in order to derive a unified view of AT formation and create a genome-scale reference database for human AT; such a data is envisaged to include alternate transcript structures, functional consequences of variations, phylogenetic conservation, and references to other major genome and proteome resources. In addition, we will seek to identify tissue- or disease-specificity of isoforms using bioinformatics approaches. This will potentially reveal co-regulated expression patterns and associated regulatory motifs involved in transcript maturation. Finally, a selection of alternative transcripts will be submitted to experimental validation using semi-quantitative RT-PCR.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales informática y ciencias de la información base de datos
- ciencias médicas y de la salud medicina básica neurología esclerosis múltiple
- ciencias médicas y de la salud medicina clínica oncología
- ciencias médicas y de la salud medicina clínica cardiología
- ciencias naturales ciencias biológicas genética genoma
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Palabras clave
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
FP6-2002-LIFESCIHEALTH
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Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Coordinador
PARIS
Francia
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.