Objetivo
The project is based on the results of the initial Marie Curie Individual Fellowship during which we have developed the simulation scheme consisting in intertwining the short interval of standard molecular dynamics simulation with the longer interval of li nearly predicted dynamics with the overall speed-up close to 6 in comparison to standard molecular dynamics simulations of a system consisting of a few hundred flexible oxygen molecules. During the reintegration phase we would like to understand better the open methodological questions of the approach. The first methodological question which will be studied is the (linear) predictability of the systems simulated with and without the cut-off, as we have empirically found that the mean square 1-step predictio n error of the system simulated without the cut-off is by two orders of magnitude lower. The other methodological question is the comparison of the linearly predicted molecular dynamics trajectory against its extrapolation based on a Taylor series. As we h ave found that the linear prediction approach provides the trajectory which is much closer to "real" trajectory, we will investigate the relation between the two. As the second part of the project we will implement the method into the gen eric simulation package and will test the efficiency of the method in simulations of the molecules of applied importance. The application of the method to more complex molecules and molecular fragments (towards the ultimate goal - proteins and DNA) will be tried and the limits of the approach will be outlined. During the second part of the project we will study the possibility to accelerate molecular dynamics simulations by using other non-traditional simulation techniques (playing the role of "vir tual dynamics"), such as autoregressive modelling and, cellular automata. We will apply the autoregressive modelling to simulate stochastic force in the simulation of polymer liquids.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales ciencias biológicas genética ADN
- ciencias naturales ciencias biológicas bioquímica biomoléculas proteínas
- ciencias naturales ciencias químicas ciencia de polímeros
- ciencias naturales ciencias físicas física molecular y química
Para utilizar esta función, debe iniciar sesión o registrarse
Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
FP6-2002-MOBILITY-11
Consulte otros proyectos de esta convocatoria
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Coordinador
KOSICE
Eslovaquia
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.