Objectif
With the advances of molecular biology technologies, DNA sequences, gene expression profiles and protein interaction data are gathered at the genome scale. The genomic era presents us with the opportunity to apprehend the collective properties of the molecular component of life at the systems level. To achieve this goal, new concepts and computational methods that allow the integration of the diverse source of biological knowledge in a common framework are required. The structure and dynamics of chromatin i n the cells must guarantee coordinated access of transcriptional regulators to promoters for efficient gene expression. It certainly constitutes an important element of genome regulation. Thus, there exists a great interest in analysing the interplay between the different aspects of biological complexity from the point of view of its physical scaffold.
Previous work have shown that gene position and orientation in prokaryotic genomes display an unexpected scale-invariant distribution that can be portrayed as an operon like structure at all scales from the gene length to the chromosome size. This organisation was interpreted as a possible signature of the coupling between transcription and the structure and dynamics of the nucleoid. Here, we propose to analys e the correlations between DNA structural properties, genome organisation, gene expression profiles and the physical or functional links between proteins in order to propose an original approach to the dynamics of genome regulation.
By using powerful techniques from signal processing (wavelet transform) and statistics (circular statistics), we will be able to determine accurately the characteristic scales pertinent to the description of genome regulation and to perform correlation studies of specific space-scale patterns present in different data types. We aim to construct a model of genome regulatory mechanisms using the concept of scale invariance.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques génétique ADN
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines
- sciences naturelles informatique et science de l'information science informatique
- sciences naturelles sciences biologiques génétique génome génome procaryote
- sciences naturelles sciences biologiques biologie moléculaire
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
FP6-2002-MOBILITY-11
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
LYON
France
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.