Molecular Subtype Specific Stem Cell Dynamics in Developing and Established Colorectal Cancers

Informations projet

CRCStemCellDynamics

N° de convention de subvention: 638193

DOI

10.3030/638193

Projet clôturé

Date de signature de la CE 30 Mars 2015

Date de début 1 Avril 2015

Date de fin 31 Mars 2021

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coût total

€ 1 499 875,00

Contribution de l’UE

€ 1 499 875,00

Coordonné par

ACADEMISCH MEDISCH CENTRUM BIJ DE UNIVERSITEIT VAN AMSTERDAM
Netherlands

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Publications

Peer reviewed articles (15)

Cancer stem cells: here, there, and everywhere

Auteurs: Sophie C. Lodestijn, Kristiaan J. Lenos, Daniël M. Miedema, Maarten F. Bijlsma, Louis Vermeulen
Publié dans: Molecular & Cellular Oncology, Numéro 6/1, 2019, Page(s) 1540235, ISSN 2372-3556
Éditeur: Frontiers
DOI: 10.1080/23723556.2018.1540235

Intestinal region-specific Wnt signalling profiles reveal interrelation between cell identity and oncogenic pathway activity in cancer development

Auteurs: Ronja S. Adam, Sanne M. van Neerven, Cayetano Pleguezuelos-Manzano, Salvatore Simmini, Nicolas Léveillé, Nina E. de Groot, Andrew N. Holding, Florian Markowetz, Louis Vermeulen
Publié dans: Cancer Cell International, Numéro 20/1, 2020, ISSN 1475-2867
Éditeur: BioMed Central
DOI: 10.1186/s12935-020-01661-6

A multidimensional network approach reveals microRNAs as determinants of the mesenchymal colorectal cancer subtype

Auteurs: E Fessler, M Jansen, F De Sousa E Melo, L Zhao, P R Prasetyanti, H Rodermond, R Kandimalla, J F Linnekamp, M Franitza, S R van Hooff, J H de Jong, S C Oppeneer, C J M van Noesel, E Dekker, G Stassi, X Wang, J P Medema, L Vermeulen
Publié dans: Oncogene, Numéro 35/46, 2016, Page(s) 6026-6037, ISSN 0950-9232
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/onc.2016.134

Practical and Robust Identification of Molecular Subtypes in Colorectal Cancer by Immunohistochemistry

Auteurs: Anne Trinh, Kari Trumpi, Felipe De Sousa E Melo, Xin Wang, Joan H. de Jong, Evelyn Fessler, Peter J.K. Kuppen, Marlies S. Reimers, Marloes Swets, Miriam Koopman, Iris D. Nagtegaal, Marnix Jansen, Gerrit K.J. Hooijer, George J.A. Offerhaus, Onno Kranenburg, Cornelis J. Punt, Jan Paul Medema, Florian Markowetz, Louis Vermeulen
Publié dans: Clinical Cancer Research, Numéro 23/2, 2017, Page(s) 387-398, ISSN 1078-0432
Éditeur: American Association for Cancer Research
DOI: 10.1158/1078-0432.ccr-16-0680

Polycomb complex PRC1 as gatekeeper of intestinal stem cell identity

Auteurs: Nicolas Léveillé, Louis Vermeulen
Publié dans: Stem Cell Investigation, Numéro 3, 2016, Page(s) 22-22, ISSN 2306-9759
Éditeur: AmeGroups
DOI: 10.21037/sci.2016.06.03

Spatiotemporal regulation of clonogenicity in colorectal cancer xenografts

Auteurs: Maartje van der Heijden, Daniël M. Miedema, Bartlomiej Waclaw, Veronique L. Veenstra, Maria C. Lecca, Lisanne E. Nijman, Erik van Dijk, Sanne M. van Neerven, Sophie C. Lodestijn, Kristiaan J. Lenos, Nina E. de Groot, Pramudita R. Prasetyanti, Andrea Arricibita Varea, Douglas J. Winton, Jan Paul Medema, Edward Morrissey, Bauke Ylstra, Martin A. Nowak, Maarten F. Bijlsma, Louis Vermeulen
Publié dans: Proceedings of the National Academy of Sciences, Numéro 116/13, 2019, Page(s) 6140-6145, ISSN 0027-8424
Éditeur: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.1813417116

A marker-independent lineage-tracing system to quantify clonal dynamics and stem cell functionality in cancer tissue

Auteurs: Kristiaan J. Lenos, Sophie C. Lodestijn, Scott K. Lyons, Maarten F. Bijlsma, Daniël M. Miedema, Louis Vermeulen
Publié dans: Nature Protocols, Numéro 14/9, 2019, Page(s) 2648-2671, ISSN 1754-2189
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41596-019-0194-y

Stem cell functionality is microenvironmentally defined during tumour expansion and therapy response in colon cancer

Auteurs: Kristiaan J. Lenos, Daniël M. Miedema, Sophie C. Lodestijn, Lisanne E. Nijman, Tom van den Bosch, Xavier Romero Ros, Filipe C. Lourenço, Maria C. Lecca, Maartje van der Heijden, Sanne M. van Neerven, Anita van Oort, Nicolas Leveille, Ronja S. Adam, Felipe de Sousa E Melo, Joy Otten, Patrick Veerman, Guillaume Hypolite, Lianne Koens, Scott K. Lyons, Giorgio Stassi, Douglas J. Winton, Jan Paul Med
Publié dans: Nature Cell Biology, Numéro 20/10, 2018, Page(s) 1193-1202, ISSN 1465-7392
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41556-018-0179-z

Bcl-2 is a critical mediator of intestinal transformation

Auteurs: Maartje van der Heijden, Cheryl D. Zimberlin, Anna M. Nicholson, Selcuk Colak, Richard Kemp, Sybren L. Meijer, Jan Paul Medema, Florian R. Greten, Marnix Jansen, Douglas J. Winton, Louis Vermeulen
Publié dans: Nature Communications, Numéro 7/1, 2016, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/ncomms10916

The consensus molecular subtypes of colorectal cancer

Auteurs: Justin Guinney, Rodrigo Dienstmann, Xin Wang, Aurélien de Reyniès, Andreas Schlicker, Charlotte Soneson, Laetitia Marisa, Paul Roepman, Gift Nyamundanda, Paolo Angelino, Brian M Bot, Jeffrey S Morris, Iris M Simon, Sarah Gerster, Evelyn Fessler, Felipe De Sousa E Melo, Edoardo Missiaglia, Hena Ramay, David Barras, Krisztian Homicsko, Dipen Maru, Ganiraju C Manyam, Bradley Broom, Valerie Boige, B
Publié dans: Nature Medicine, Numéro 21/11, 2015, Page(s) 1350-1356, ISSN 1078-8956
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/nm.3967

Wnt Signaling in Cancer Stem Cell Biology

Auteurs: Felipe de Sousa e Melo, Louis Vermeulen
Publié dans: Cancers, Numéro 8/7, 2016, Page(s) 60, ISSN 2072-6694
Éditeur: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/cancers8070060

Tumour budding is associated with the mesenchymal colon cancer subtype and RAS/RAF mutations: a study of 1320 colorectal cancers with Consensus Molecular Subgroup (CMS) data

Auteurs: Anne Trinh, Claudia Lädrach, Heather E. Dawson, Sanne ten Hoorn, Peter J. K. Kuppen, Marlies S. Reimers, Miriam Koopman, Cornelis J. A. Punt, Alessandro Lugli, Louis Vermeulen, Inti Zlobec
Publié dans: British Journal of Cancer, Numéro 119/10, 2018, Page(s) 1244-1251, ISSN 0007-0920
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41416-018-0230-7

Balancing signals in the intestinal niche

Auteurs: Sanne M Neerven, Louis Vermeulen
Publié dans: The EMBO Journal, Numéro 36/4, 2017, Page(s) 389-391, ISSN 0261-4189
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.15252/embj.201796431

Chromosomal copy number heterogeneity predicts survival rates across cancers

Auteurs: Erik van Dijk, Tom van den Bosch, Kristiaan J. Lenos, Khalid El Makrini, Lisanne E. Nijman, Hendrik F. B. van Essen, Nico Lansu, Michiel Boekhout, Joris H. Hageman, Rebecca C. Fitzgerald, Cornelis J. A. Punt, Jurriaan B. Tuynman, Hugo J. G. Snippert, Geert J. P. L. Kops, Jan Paul Medema, Bauke Ylstra, Louis Vermeulen, Daniël M. Miedema
Publié dans: Nature Communications, Numéro 12/1, 2021, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-021-23384-6

Apc-mutant cells act as supercompetitors in intestinal tumour initiation

Auteurs: Sanne M. van Neerven, Nina E. de Groot, Lisanne E. Nijman, Brendon P. Scicluna, Milou S. van Driel, Maria C. Lecca, Daniël O. Warmerdam, Vaishali Kakkar, Leandro F. Moreno, Felipe A. Vieira Braga, Delano R. Sanches, Prashanthi Ramesh, Sanne ten Hoorn, Arthur S. Aelvoet, Marouska F. van Boxel, Lianne Koens, Przemek M. Krawczyk, Jan Koster, Evelien Dekker, Jan Paul Medema, Douglas J. Winton, Maarte
Publié dans: Nature, Numéro 594/7863, 2021, Page(s) 436-441, ISSN 0028-0836
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-021-03558-4