Emergence of novel phenotypes in co-evolving biological systems: allelic diversification and dominance at the Self-incompatibility locus in Arabidopsis.

Informations projet

NOVEL

N° de convention de subvention: 648321

DOI

10.3030/648321

Projet clôturé

Date de signature de la CE 1 Septembre 2015

Date de début 1 Octobre 2015

Date de fin 31 Mai 2021

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coût total

€ 1 760 880,00

Contribution de l’UE

€ 1 760 880,00

Coordonné par

CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE CNRS
France

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Publications

Other (3)

A New Tree-Based Methodological Framework to Infer the Evolutionary History of Mesopolyploid Lineages: An Application to the Brassiceae Tribe (Brassicaceae)

Auteurs: Laura Hénocq, Sophie Gallina, Eric Schmitt, Vincent Castric, Xavier Vekemans, Céline Poux
Publié dans: 2020
Éditeur: Cold Spring Harbor
DOI: 10.1101/2020.01.09.900571

Population-level consequences of inheritable somatic mutations and the evolution of mutation rates in plants

Auteurs: Thomas Lesaffre
Publié dans: 2020
Éditeur: Cold Spring Harbor
DOI: 10.1101/2020.09.29.318402

Genetic mapping of sex and self-incompatibility determinants in the androdioecious plant Phillyrea angustifolia

Auteurs: Amelie Carre, Sophie Gallina, Sylvain Santoni, Philippe Vernet, Cecile Gode, Vincent Castric, Pierre Saumitou-Laprade
Publié dans: 2021
Éditeur: Cold Spring Harbour
DOI: 10.1101/2021.04.15.439943

Peer reviewed articles (17)

Whole‐genome sequencing and genome regions of special interest: Lessons from major histocompatibility complex, sex determination, and plant self‐incompatibility

Auteurs: Xavier Vekemans, Vincent Castric, Helen Hipperson, Niels A. Müller, Helena Westerdahl, Quentin Cronk
Publié dans: Molecular Ecology, 2021, ISSN 0962-1083
Éditeur: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/mec.16020

The unusual S locus of Leavenworthia is composed of two sets of paralogous loci

Auteurs: Sier-Ching Chantha, Adam C. Herman, Vincent Castric, Xavier Vekemans, William Marande, Daniel J. Schoen
Publié dans: New Phytologist, Numéro 216/4, 2017, Page(s) 1247-1255, ISSN 0028-646X
Éditeur: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/nph.14764

Controlling for genetic identity of varieties, pollen contamination and stigma receptivity is essential to characterize the self-incompatibility system of Olea europaea L.

Auteurs: Pierre Saumitou-Laprade, Philippe Vernet, Xavier Vekemans, Vincent Castric, Gianni Barcaccia, Bouchaïb Khadari, Luciana Baldoni
Publié dans: Evolutionary Applications, Numéro 10/9, 2017, Page(s) 860-866, ISSN 1752-4571
Éditeur: Wiley
DOI: 10.1111/eva.12498

Genome sequencing reveals the origin of the allotetraploid Arabidopsis suecica

Auteurs: Polina Yu. Novikova, Takashi Tsuchimatsu, Samson Simon, Viktoria Nizhynska, Viktor Voronin, Robin Burns, Olga M. Fedorenko, Svante Holm, Torbjörn Säll, Elisa Prat, William Marande, Vincent Castric, Magnus Nordborg
Publié dans: Molecular Biology and Evolution, 2017, Page(s) msw299, ISSN 0737-4038
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/molbev/msw299

Patterns of Polymorphism at the Self-Incompatibility Locus in 1,083 Arabidopsis thaliana Genomes

Auteurs: Takashi Tsuchimatsu, Pauline M. Goubet, Sophie Gallina, Anne-Catherine Holl, Isabelle Fobis-Loisy, Hélène Bergès, William Marande, Elisa Prat, Dazhe Meng, Quan Long, Alexander Platzer, Magnus Nordborg, Xavier Vekemans, Vincent Castric
Publié dans: Molecular Biology and Evolution, 2017, ISSN 0737-4038
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/molbev/msx122

Evolution of self‐incompatibility in the Brassicaceae: Lessons from a textbook example of natural selection

Auteurs: Eléonore Durand, Maxime Chantreau, Audrey Le Veve, Roman Stetsenko, Manu Dubin, Mathieu Genete, Violaine Llaurens, Céline Poux, Camille Roux, Sylvain Billiard, Xavier Vekemans, Vincent Castric
Publié dans: Evolutionary Applications, Numéro 13/6, 2020, Page(s) 1279-1297, ISSN 1752-4571
Éditeur: Wiley
DOI: 10.1111/eva.12933

On Deleterious Mutations in Perennials: Inbreeding Depression, Mutation Load, and Life-History Evolution

Auteurs: Thomas Lesaffre, Sylvain Billiard
Publié dans: The American Naturalist, Numéro 197/5, 2021, Page(s) E143-E155, ISSN 0003-0147
Éditeur: University of Chicago Press
DOI: 10.1086/713499

The joint evolution of lifespan and self‐fertilization

Auteurs: Thomas Lesaffre, Sylvain Billiard
Publié dans: Journal of Evolutionary Biology, Numéro 33/1, 2019, Page(s) 41-56, ISSN 1010-061X
Éditeur: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/jeb.13543

Stochastic Dynamics of Three Competing Clones: Conditions and Times for Invasion, Coexistence, and Fixation

Auteurs: Sylvain Billiard, Charline Smadi
Publié dans: The American Naturalist, Numéro 195/3, 2020, Page(s) 463-484, ISSN 0003-0147
Éditeur: University of Chicago Press
DOI: 10.1086/707017

Genotyping and De Novo Discovery of Allelic Variants at the Brassicaceae Self-Incompatibility Locus from Short-Read Sequencing Data

Auteurs: Mathieu Genete, Vincent Castric, Xavier Vekemans
Publié dans: Molecular Biology and Evolution, Numéro 37/4, 2019, Page(s) 1193-1201, ISSN 0737-4038
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/molbev/msz258

Base-Pairing Requirements for Small RNA-Mediated Gene Silencing of Recessive Self-Incompatibility Alleles in Arabidopsis halleri

Auteurs: Nicolas Burghgraeve, Samson Simon, Simon Barral, Isabelle Fobis-Loisy, Anne-Catherine Holl, Chloé Ponitzki, Eric Schmitt, Xavier Vekemans, Vincent Castric
Publié dans: Genetics, Numéro 215/3, 2020, Page(s) 653-664, ISSN 0016-6731
Éditeur: Genetics Society of America
DOI: 10.1534/genetics.120.303351

Maintenance of Adaptive Dynamics and No Detectable Load in a Range-Edge Outcrossing Plant Population

Auteurs: Margarita Takou, Tuomas Hämälä, Evan M Koch, Kim A Steige, Hannes Dittberner, Levi Yant, Mathieu Genete, Shamil Sunyaev, Vincent Castric, Xavier Vekemans, Outi Savolainen, Juliette de Meaux
Publié dans: Molecular Biology and Evolution, Numéro 38/5, 2021, Page(s) 1820-1836, ISSN 1537-1719
Éditeur: OUP
DOI: 10.1093/molbev/msaa322

Asymmetrical diversification of the receptor-ligand interaction controlling self-incompatibility in Arabidopsis

Auteurs: Maxime Chantreau, Céline Poux, Marc F Lensink, Guillaume Brysbaert, Xavier Vekemans, Vincent Castric
Publié dans: eLife, Numéro 8, 2019, ISSN 2050-084X
Éditeur: eLife Sciences Publications
DOI: 10.7554/elife.50253

Bulk pollen sequencing reveals rapid evolution of segregation distortion in the male germline of Arabidopsis hybrids

Auteurs: Russell Corbett-Detig, Paloma Medina, Hélène Frérot, Christelle Blassiau, Vincent Castric
Publié dans: Evolution Letters, Numéro 3/1, 2019, Page(s) 93-103, ISSN 2056-3744
Éditeur: SSE
DOI: 10.1002/evl3.96

Breakdown of gametophytic self‐incompatibility in subdivided populations

Auteurs: Thomas Brom, Vincent Castric, Sylvain Billiard
Publié dans: Evolution, Numéro 74/2, 2019, Page(s) 270-282, ISSN 0014-3820
Éditeur: Society for the Study of Evolution
DOI: 10.1111/evo.13897

Genetic basis and timing of a major mating system shift in Capsella

Auteurs: Jörg A. Bachmann, Andrew Tedder, Benjamin Laenen, Marco Fracassetti, Aurélie Désamoré, Clément Lafon‐Placette, Kim A. Steige, Caroline Callot, William Marande, Barbara Neuffer, Hélène Bergès, Claudia Köhler, Vincent Castric, Tanja Slotte
Publié dans: New Phytologist, Numéro 224/1, 2019, Page(s) 505-517, ISSN 0028-646X
Éditeur: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/nph.16035

When the genetic architecture matters: evolutionary and ecological implications of self versus nonself recognition in plant self‐incompatibility

Auteurs: Xavier Vekemans, Vincent Castric
Publié dans: New Phytologist, Numéro 231/4, 2021, Page(s) 1304-1307, ISSN 0028-646X
Éditeur: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/nph.17471

Non-peer reviewed articles (1)

Differential retention of transposable element-derived sequences in outcrossing Arabidopsis genomes

Auteurs: Sylvain Legrand, Thibault Caron, Florian Maumus, Sol Schvartzman, Leandro Quadrana, Eléonore Durand, Sophie Gallina, Maxime Pauwels, Clément Mazoyer, Lucie Huyghe, Vincent Colot, Marc Hanikenne, Vincent Castric
Publié dans: Mobile DNA, Numéro 10/1, 2019, ISSN 1759-8753
Éditeur: BioMed Central
DOI: 10.1186/s13100-019-0171-6