Objetivo
Comparisons among whole genome sequences allow us to survey differences in gene content among organisms, and hypothesise patterns of gene gain and loss through evolution. Rates of gene flux appear to be surprisingly high, and many genes are unexpectedly unique to species (“orphan” genes). In plants, increasing evidence suggests that genome evolution has been shaped by multiple rounds of whole genome duplication (WGD) after which many duplicated genes are lost, but some duplicates are retained and diverge. The extent to which novel genes arise due to WGD, tandem duplications, horizontal gene transfers, or de novo, remains an open question, especially in plants where WGD seems to be such a pervasive feature of evolution. Our knowledge is hampered by the fact that until now we have been limited to comparisons of whole genome sequences in plants that are highly diverged from one another. This means that the early consequences of gene duplication, and the early divergence of duplicated genes, have not been studied on a genomic scale. This project will use a new dataset, generated by the host lab, containing the whole genome sequence of every species within a plant genus (the genus Fraxinus – ash trees). As well as having inferred WGDs in its ancestry, this genus contains species that have undergone recent WGD. We propose to conduct a comprehensive analysis of gene and gene family evolution in this genus, compiling a major public database of Fraxinus gene families (FraxiFam). Using this data we will conduct the first genome-wide and genus-wide study of gene content evolution, allowing us to study the early stages of gene sequence and gene content divergence. We will test hypotheses about: (1) the primary drivers of gene content evolution, (2) the repeatability of patterns in gene loss and retention after WGD, and (3) the early evolution of orphan genes. This research will contribute to attempts to develop ash trees resistant to ash dieback, for EU ecological restoration.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales ciencias biológicas morfología biológica morfología comparativa
- ciencias naturales ciencias biológicas genética ADN
- ciencias naturales ciencias biológicas microbiología micología
- ciencias naturales ciencias biológicas genética genoma
- ciencias naturales ciencias químicas
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Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
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H2020-EU.1.3. - EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions
PROGRAMA PRINCIPAL
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H2020-EU.1.3.2. - Nurturing excellence by means of cross-border and cross-sector mobility
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Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
MSCA-IF-EF-ST - Standard EF
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Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
(se abrirá en una nueva ventana) H2020-MSCA-IF-2014
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Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.
E1 4NS LONDON
Reino Unido
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.