Institut Curie 3-i PhD Program

Informations projet

IC-3i-PhD

N° de convention de subvention: 666003

DOI

10.3030/666003

Projet clôturé

Date de signature de la CE 13 Mai 2015

Date de début 1 Septembre 2016

Date de fin 31 Août 2022

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions

Coût total

€ 5 493 600,00

Contribution de l’UE

€ 2 746 800,00

Coordonné par

INSTITUT CURIE
France

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Livrables

Documents, reports (2)

Periodic report on dissemination activities 2

The report on dissemination activities should contain at least the following information Dates of Call Publication and places where it was published Flyers brochures or other information produced Presentations conferences and meetings or other events Published articles in the press Any other means of advertising the programme

Periodic report on dissemination activities 1

The report on dissemination activities should contain at least: - Dates of Call Publication and places where it was published (Supporting documents required). - Flyers, brochures, or other information produced - Presentations conferences and meetings or other events - Published articles in the press - Any other means of advertising the programme

Publications

Peer reviewed articles (38)

Stem Cell DNA Damage and Genome Mutation in the Context of Aging and Cancer Initiation

Auteurs: Lara Al-Zouabi and Alison Bardin
Publié dans: Cold Spring Harbor Perspectives in Biology, 2020, Page(s) -, ISSN 1943-0264
Éditeur: Cold Spring Harbor Laboratory Press
DOI: 10.1101/cshperspect.a036210

Multiscale morphogenesis of the mouse blastocyst by actomyosin contractility.

Auteurs: Özge Özgüç; Jean-Léon Maître
Publié dans: Current Opinion in Cell Biology, Numéro Volume 66, 2020, Page(s) 123-129, ISSN 0955-0674
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.ceb.2020.05.002

BAP1 complex promotes transcription by opposing PRC1-mediated H2A ubiquitylation.

Auteurs: Campagne, Antoine; Lee, Ming-Kang; Zielinski, Dina; Michaud, Audrey; Le Corre, Stéphanie; Dingli, Florent; Chen, Hong; Shahidian, Lara Z.; Vassilev, Ivaylo; Servant, Nicolas; Loew, Damarys; Pasmant, Eric; Postel-Vinay, Sophie; Wassef, Michel; Margueron, Raphaël
Publié dans: Nature Communications, Numéro 10, 2019, Page(s) pp.348, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-018-08255-x

Recent advances towards deciphering human dendritic cell development

Auteurs: Javiera Villar, Elodie Segura
Publié dans: Molecular Immunology, Numéro Volume 122, 2020, Page(s) Pages 109-115, ISSN 0161-5890
Éditeur: Pergamon Press
DOI: 10.1016/j.molimm.2020.04.004

Synthetic reconstruction of the hunchback promoter specifies the role of Bicoid, Zelda and Hunchback in the dynamics of its transcription

Auteurs: Huy Tran; Gonçalo Fernandes; Maxime Andrieu; Youssoupha Diaw; Carmina Perez Romero; Cécile Fradin; Mathieu Coppey; Aleksandra M Walczak; Nathalie Dostatni
Publié dans: eLife, 2022, ISSN 2050-084X
Éditeur: eLife Sciences Publications
DOI: 10.7554/elife.74509

Transcription factor EB regulates phosphatidylinositol-3-phosphate levels that control lysosome positioning in the bladder cancer model

Auteurs: Mathur, P., De Barros Santos, C., Lachuer, H. et al.
Publié dans: Commun Biol, Numéro 6, 2022, Page(s) 114, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s42003-023-04501-1

The human pre-replication complex is an open complex

Auteurs: Jian Li, Jiangqing Dong, Weitao Wang, Daqi Yu, Xinyu Fan, et al.
Publié dans: Cell, Numéro 186 (1), 2022, Page(s) 98-111, ISSN 0092-8674
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cell.2022.12.008

Review of Experimental Studies to Improve Radiotherapy Response in Bladder Cancer: Comments and Perspectives

Auteurs: Linda Silina, Fatlinda Maksut,Isabelle Bernard-Pierrot,François Radvanyi,Gilles Créhange,Frédérique Mégnin-Chanet and Pierre Verrelle
Publié dans: Cancers, Numéro 13(1), 2021, Page(s) 87, ISSN 2072-6694
Éditeur: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/cancers13010087

Acridine–O6-benzylguanine hybrids: Synthesis, DNA binding, MGMT inhibition and antiproliferative activity

Auteurs: Jaime Franco Pinto, Alexandra Fillion, Patricia Duchambon, Sophie Bombard, Anton Granzhan
Publié dans: European Journal of Medicinal Chemistry, Numéro Volume 227, 2022, Page(s) 11390, ISSN 0223-5234
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.ejmech.2021.113909

Ubiquitin-like protein 3 (UBL3) is required for MARCH ubiquitination of major histocompatibility complex class II and CD86

Auteurs: Haiyin Liu, Kayla R Wilson, Ashley M Firth, Christophe Macri, Patrick Schriek, Annabelle B Blum, Javiera Villar, Samuel Wormald, Mitch Shambrook, Bangyan Xu, Hui Jing Lim, Hamish E G McWilliam, Andrew F Hill, Laura E Edgington-Mitchell , Irina Caminschi , Mireille H Lahoud, Elodie Segura, Marco J Herold, Jose A Villadangos, Justine D Mintern
Publié dans: Nature Communications, Numéro 13, 2022, Page(s) 1934, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-022-29524-w

Stiffness and tension gradients of the hair cell’s tip-link complex in the mammalian cochlea

Auteurs: Mélanie Tobin, Atitheb Chaiyasitdhi, Vincent Michel, Nicolas Michalski, Pascal Martin
Publié dans: eLife, Numéro 8, 2019, Page(s) -, ISSN 2050-084X
Éditeur: eLife Sciences Publications
DOI: 10.7554/elife.43473

Germline MBD4 Mutations and Predisposition to Uveal Melanoma

Auteurs: Anne-Céline Derrien; Manuel Rodrigues; Manuel Rodrigues; Alexandre Eeckhoutte; Stéphane Dayot; Alexandre Houy; Lenha Mobuchon; Sophie Gardrat; Sophie Gardrat; Delphine Lequin; Stelly Ballet; Gaëlle Pierron; Samar Alsafadi; Samar Alsafadi; Odette Mariani; Ahmed El-Marjou; Alexandre Matet; Alexandre Matet; Chrystelle Colas; Nathalie Cassoux; Nathalie Cassoux; Marc-Henri Stern; Marc-Henri Stern
Publié dans: ournal of the National Cancer Institute, Numéro Volume 113, Numéro 1, 2021, Page(s) Pages 80–87, ISSN 0027-8874
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/jnci/djaa047

Emerging Therapeutic Opportunities Based on Current Knowledge of Uveal Melanoma Biology.

Auteurs: Vivet-Noguer, Raquel; Tarin, Malcy; Roman-Roman, Sergio; Alsafadi, Samar
Publié dans: Cancers, Numéro Iss 7, Vol 11,, 2019, Page(s) p 1019, ISSN 2072-6694
Éditeur: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/cancers11071019

Interpretable network-guided epistasis detection

Auteurs: Diane Duroux; Héctor Climente-Gonzáles; Chloé-Agathe Azencott; Kristel Van Steen
Publié dans: https://hal-mines-paristech.archives-ouvertes.fr/hal-03114245, Numéro 11, 2022, Page(s) 1-14, ISSN 0029-3970
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/gigascience/giab093

Spatial transcriptomics for respiratory research and medicine

Auteurs: Sandra Curras-Alonso, Juliette Soulier, Thomas Walter, Florian Mueller, Arturo Londoño-Vallejo and Charles Fouillade
Publié dans: European Respiratory Journal, Numéro 58 (1), 2021, Page(s) 2004314, ISSN 0903-1936
Éditeur: European Respiratory Society
DOI: 10.1183/13993003.04314-2020

Boosting GWAS using biological networks: A study on susceptibility to familial breast cancer

Auteurs: Héctor Climente-González; Christine Lonjou; Christine Lonjou; Fabienne Lesueur; Fabienne Lesueur; Dominique Stoppa-Lyonnet; Dominique Stoppa-Lyonnet; Dominique Stoppa-Lyonnet; Nadine Andrieu; Nadine Andrieu; Chloé-Agathe Azencott; Chloé-Agathe Azencott
Publié dans: PLoS Computational Biology, Numéro 17(3), 2021, ISSN 1553-734X
Éditeur: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.pcbi.1008819

Cortical softening elicits zygotic contractility during mouse preimplantation development

Auteurs: Özge Özgüç; Ludmilla de Plater; Varun Kapoor; Anna Francesca Tortorelli; Andrew G. Clark; Jean-Léon Maître
Publié dans: PLOS Biology, Numéro 20(3), 2022, ISSN 1544-9173
Éditeur: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.pbio.3001593

Block HSIC Lasso

Auteurs: Climente-González, Héctor; Azencott, Chloé Agathe; Kaski, Samuel; Yamada, Makoto
Publié dans: Bioinformatics, Numéro Volume 35, issue 14, 2019, ISSN 1367-4803
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/bioinformatics/btz333

Melanin Transfer and Fate within Keratinocytes in Human Skin Pigmentation

Auteurs: Silvia Benito-Martínez, Laura Salavessa, Graça Raposo, Michael S Marks, Cédric Delevoye
Publié dans: Integrative and Comparative Biology, Numéro Volume 61, Numéro 4, 2021, Page(s) Pages 1546–1555, ISSN 1540-7063
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/icb/icab094

Research Techniques Made Simple: Cell Biology Methods for the Analysis of Pigmentation

Auteurs: Silvia Benito-Martínez, Yueyao Zhu, Riddhi Atul Jani, Dawn C. Harper, Michael S. Marks, Cédric Delevoye
Publié dans: Journal of Investigative Dermatology, Numéro Volume 140, Numéro 2, 2020, Page(s) 257-268, ISSN 0022-202X
Éditeur: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1016/j.jid.2019.12.002

CARM1/PRMT4: Making Its Mark beyond ItsFunction as a Transcriptional Coactivator

Auteurs: Samyuktha Suresh, Solène Huard, Thierry Dubois
Publié dans: Trends in Cell Biology, Numéro Volume 31, Numéro 5, 2021, Page(s) 402-417, ISSN 0962-8924
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.tcb.2020.12.010

Abstracts

Auteurs: Mikhajlov
Publié dans: European Biophysics Journal, Numéro 46/S1, 2017, Page(s) 43-402, ISSN 0175-7571
Éditeur: Springer Verlag
DOI: 10.1007/s00249-017-1222-x

Systematic Analysis of Splice-Site-Creating Mutations in Cancer

Auteurs: Reyka G. Jayasinghe, Song Cao, Qingsong Gao, Michael C. Wendl, Nam Sy Vo, Sheila M. Reynolds, Yanyan Zhao, Héctor Climente-González, Shengjie Chai, Fang Wang, Rajees Varghese, Mo Huang, Wen-Wei Liang, Matthew A. Wyczalkowski, Sohini Sengupta, Zhi Li, Samuel H. Payne, David Fenyö, Jeffrey H. Miner, Matthew J. Walter, Benjamin Vincent, Eduardo Eyras, Ken Chen, Ilya Shmulevich, Feng Chen, Li Ding,
Publié dans: Cell Reports, Numéro 23/1, 2018, Page(s) 270-281.e3, ISSN 2211-1247
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.celrep.2018.03.052

Harnessing an emissive guanine surrogate to design small-molecule fluorescent chemosensors of O6-methylguanine-DNA-methyltransferase (MGMT)

Auteurs: Alexandra Fillion,Jaime Franco Pinto, Anton Granzhan
Publié dans: Organic and biomolecular chemistry, Numéro 2;20(9), 2022, Page(s) 1888-1892, ISSN 1477-0520
Éditeur: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d2ob00208f

Preclinical evaluation of drug combinations identifies co-inhibition of Bcl-2/XL/W and MDM2 as a potential therapy in uveal melanoma

Auteurs: Didier Decaudin, Estelle Frisch Dit Leitz, Fariba Nemati, Malcy Tarin, Adnan Naguez, Mohamed Zerara, Benjamin Marande, Raquel Vivet-Noguer, Ensar Halilovic, Claire Fabre, Aart Jochemsen, Sergio Roman-Roman, Samar Alsafadi
Publié dans: European Journal of Cancer, Numéro 126, 2020, Page(s) 93-103, ISSN 0959-8049
Éditeur: Pergamon Press Ltd.
DOI: 10.1016/j.ejca.2019.12.012

Multiscale analysis of single and double maternal-zygotic Myh9 and Myh10 mutants during mouse preimplantation development.

Auteurs: Markus Frederik Schliffka; Markus Frederik Schliffka; Anna Francesca Tortorelli; Özge Özgüç; Ludmilla de Plater; Oliver Polzer; Diane Pelzer; Jean-Léon Maître
Publié dans: eLife, 2021, ISSN 2050-084X
Éditeur: eLife Sciences Publications
DOI: 10.7554/elife.68536

Erythropoietin directly remodels the clonal composition of murine hematopoietic multipotent progenitor cells

Auteurs: Almut S Eisele; Jason Cosgrove; Aurelie Magniez; Emilie Tubeuf; Sabrina Tenreira Bento; Cecile Conrad; Fanny Cayrac; Tamar Tak; Anne-Marie Lyne; Jos Urbanus; Leïla Perié
Publié dans: eLife, 2022, ISSN 2050-084X
Éditeur: eLife Sciences Publications
DOI: 10.7554/elife.66922

The More, the Merrier: DC3s Join the Human Dendritic Cell Family

Auteurs: Javiera Villar, Elodie Segura
Publié dans: Immunity, Numéro Volume 53, Numéro 2, 2020, Page(s) 233-235, ISSN 1074-7613
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.immuni.2020.07.014

FLASH Irradiation Spares Lung Progenitor Cells and Limits the Incidence of Radio-induced Senescence

Auteurs: Charles Fouillade, Sandra Curras-Alonso, Lorena Giuranno, Eddy Quelennec, Sophie Heinrich, Sarah Bonnet-Boissinot, Arnaud Beddok, Sophie Leboucher, Hamza Umut Karakurt, Mylène Bohec, Sylvain Baulande, Marc Vooijs, Pierre Verrelle, Marie Dutreix, Arturo Londoño-Vallejo, Vincent Favaudon
Publié dans: Clinical Cancer Research, Numéro 15;26(6), 2020, Page(s) 1497-1506, ISSN 1078-0432
Éditeur: American Association for Cancer Research
DOI: 10.1158/1078-0432.ccr-19-1440

Roles of Actin in the Morphogenesis of the Early Caenorhabditis elegans Embryo

Auteurs: Dureen Samandar Eweis; Dureen Samandar Eweis; Julie Plastino; Julie Plastino
Publié dans: International Journal of Molecular Sciences, Numéro 21(10), 2020, ISSN 1422-0067
Éditeur: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/ijms21103652

Developing an advanced gut on chip model enabling the study of epithelial cell/fibroblast interactions

Auteurs: Marine Verhulsel, Anthony Simon, Moencopi Bernheim-Dennery, Venkata Ram Gannavarapu, Lauriane Gérémie, Davide Ferraro, Denis Krndija, Laurence Talini, Jean-Louis Viovy, Danijela Matic Vignjevic, Stéphanie Descroix
Publié dans: Lab Chip, Numéro 21, 2021, Page(s) 365, ISSN 1473-0197
Éditeur: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d0lc00672f

An interhemispheric neural circuit allowing binocular integration in the optic tectum.

Auteurs: Gebhardt, Christoph; Auer, Thomas O.; Henriques, Pedro M.; Rajan, Gokul; Duroure, Karine; Bianco, Isaac H.; Del Bene, Filippo
Publié dans: Nature Communications, Numéro 10, 2019, Page(s) 5471, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-019-13484-9

Decoding the Heterogeneity of Human Dendritic Cell Subsets

Auteurs: Javiera Villar; Elodie Segura
Publié dans: Trends in Inmunology, Numéro Volume 41, Numéro 12, 2020, Page(s) Pages 1062-107, ISSN 1471-4906
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.it.2020.10.002

Spen limits intestinal stem cell self-renewal

Auteurs: Maheva Andriatsilavo, Marine Stefanutti, Katarzyna Siudeja, Carolina N Perdigoto, Benjamin Boumard, Louis Gervais, Alexandre Gillet-Markowska, Lara Al Zouabi, François Schweisguth, Allison J Bardin
Publié dans: PLOS Genetics, Numéro 14(11), 2018, Page(s) -, ISSN 1553-7390
Éditeur: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.pgen.1007773

Evolutionary divergence of locomotion in two related vertebrate species

Auteurs: Gokul Rajan; Julie Lafaye; Martin Carbo-Tano; Karine Duroure; Giulia Faini; Dimitrii Tanese; Thomas Panier; Raphaël Candelier; Joerg Henninger; Ralf Britz; Benjamin Judkewitz; Christoph Gebhardt; Valentina Emiliani; Georges Debrégeas; Claire Wyart; Filippo Del Bene
Publié dans: Cell Reports, Numéro Volume 38, Numéro 13, 2022, ISSN 2211-1247
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.celrep.2022.110585

TYRO3 as a molecular target for growth inhibition and apoptosis induction in bladder cancer.

Auteurs: Florent Dufour; Florent Dufour; Linda Silina; Linda Silina; Hélène Neyret-Kahn; Hélène Neyret-Kahn; Aura Moreno-Vega; Aura Moreno-Vega; Clémentine Krucker; Clémentine Krucker; Narjesse Karboul; Narjesse Karboul; Marion Dorland-Galliot; Marion Dorland-Galliot; Pascale Maillé; Elodie Chapeaublanc; Elodie Chapeaublanc; Yves Allory; Yves Allory; Nicolas Stransky; Nicolas Stransky; Hélène Haeg
Publié dans: British Journal of Cancer, Numéro 120 (5), 2019, Page(s) pp.555-564, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41416-019-0397-6

Protein arginine methyltransferase 5: A novel therapeutic target for triple-negative breast cancers

Auteurs: Mathilde Vinet, Samyuktha Suresh, Virginie Maire, Clarisse Monchecourt, Fariba Némati, Laetitia Lesage, Fabienne Pierre, Mengliang Ye, Auriane Lescure, Amélie Brisson, Didier Meseure, André Nicolas, Guillem Rigaill, Elisabetta Marangoni, Elaine Del Nery, Sergio Roman‐Roman, and Thierry Dubois
Publié dans: Cancer Medicine, Numéro Volume 8, Numéro 5, 2019, Page(s) 2414–2428, ISSN 2045-7634
Éditeur: John Wiley & Sons
DOI: 10.1002/cam4.2114

Asymmetry is defined during meiosis in the oocyte of the parthenogenetic nematode Diploscapter pachys

Auteurs: Dureen Samandar Eweis; Marie Delattre; Julie Plastino
Publié dans: Developmental Biology, Numéro 00121606, 2022, Page(s) Pages 13-21, ISSN 0012-1606
Éditeur: Academic Press
DOI: 10.1016/j.ydbio.2021.12.013

Other (3)

Controlling Confinement and Topology to Study Collective Cell Behaviors

Auteurs: Guillaume Duclos, Maxime Deforet, Hannah G. Yevick, Olivier Cochet-Escartin, Flora Ascione, Sarah Moitrier, Trinish Sarkar, Victor Yashunsky, Isabelle Bonnet, Axel Buguin, Pascal Silberzan
Publié dans: Cell Migration. Methods in Molecular Biology, Numéro vol 1749, 2018, Page(s) pp 387–399, ISBN 978-1-4939-7700-0
Éditeur: Humana Press
DOI: 10.1007/978-1-4939-7701-7_28

The 2020 motile active matter roadmap

Auteurs: Gerhard Gompper, Roland G Winkler, Thomas Speck, Alexandre Solon, Cesare Nardini, Fernando Peruani, Hartmut Löwen, Ramin Golestanian, U Benjamin Kaupp, Luis Alvarez, Thomas Kiørboe, Eric Lauga, Wilson C K Poon, Antonio DeSimone, Santiago Muiños-Landin, Alexander Fischer, Nicola A Söker, Frank Cichos, Raymond Kapral, Pierre Gaspard, Marisol Ripoll, Francesc Sagues, Amin Doostmohammadi, Julia M
Publié dans: Journal of Physics: Condensed Matter, Numéro 193001, 2020, Page(s) 67pp, ISSN 0953-8984
Éditeur: IOP Publishing
DOI: 10.1088/1361-648x/ab6348

The 2019 Motile Active Matter Roadmap

Auteurs: Gompper, Gerhard; Winkler, Roland G.; Speck, Thomas; Solon, Alexandre; Nardini, Cesare; Peruani, Fernando; Loewen, Hartmut; Golestanian, Ramin; Kaupp, U. Benjamin; Alvarez, Luis; Kioerboe, Thomas; Lauga, Eric; Poon, Wilson; De Simone, Antonio; Cichos, Frank; Fischer, Alexander; Landin, Santiago Muinos; Soeker, Nicola; Kapral, Raymond; Gaspard, Pierre; Ripoll, Marisol; Sagues, Francesc; Yeomans, Ju
Publié dans: arXiv, 2019, ISSN 2331-8422
Éditeur: Cornell University
DOI: 10.48550/arxiv.1912.06710

Book chapters (1)

Genome-wide mapping of human DNA replication by optical replication mapping supports a stochastic model of eukaryotic replication

Auteurs: Wang W, Klein KN, Proesmans K, Yang H, Marchal C, Zhu X, Borrman T, Hastie A, Weng Z, Bechhoefer J, Chen CL, Gilbert DM, Rhind N.
Publié dans: Mol Cell, Numéro Jul 15;81(14), 2021, Page(s) 2975-2988, ISSN 1940-3402
Éditeur: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1016/j.molcel.2021.05.024

Monographic books (1)

Real Time de novo Deposition of Centromeric Histone-associated Proteins Using the Auxin Inducible Degradation System

Auteurs: Hoffmann, Sebastian; Fachinetti, Daniele
Publié dans: Histone Variants. Methods in Molecular Biology, Numéro vol 1832, 2018, ISBN 978-1-4939-8663-7
Éditeur: Humana Press
DOI: 10.1007/978-1-4939-8663-7_12

Droits de propriété intellectuelle

Patent (1)

METALLIC TRANS-(N-HETEROCYCLIC CARBENE)-AMINE-PLATINUM COMPLEXES AND USES THEREOF FOR TREATING CANCER

Numéro de demande/publication: 20 21078966
Date: 2021-10-19
Demandeur(s): INSTITUT CURIE