TACK Superphylum and Lokiarchaeota Evolution: Dissecting the Ecology and Evolution of Archaea to Elucidate the Prokaryote to Eukaryote Transition

Información del proyecto

TACKLE

Identificador del acuerdo de subvención: 695192

DOI

10.3030/695192

Proyecto cerrado

Fecha de la firma de la CE 28 Julio 2016

Fecha de inicio 1 Agosto 2016

Fecha de finalización 31 Julio 2022

Financiado con arreglo a

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coste total

€ 2 500 000,00

Aportación de la UE

€ 2 500 000,00

Coordinado por

UNIVERSITAT WIEN
Austria

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Publicaciones

Peer reviewed articles (17)

Comparative CRISPR type III-based knockdown of essential genes in hyperthermophilic Sulfolobales and the evasion of lethal gene silencing

Autores: Isabelle Anna Zink, Thomas Fouqueau, Gabriel Tarrason Risa, Finn Werner, Buzz Baum, Udo Bläsi, Christa Schleper
Publicado en: RNA Biology, Edición 18/3, 2021, Página(s) 421-434, ISSN 1547-6286
Editor: Landes Bioscience
DOI: 10.1080/15476286.2020.1813411

Ancestral Reconstructions Decipher Major Adaptations of Ammonia-Oxidizing Archaea upon Radiation into Moderate Terrestrial and Marine Environments

Autores: Sophie S. Abby, Melina Kerou, Christa Schleper
Publicado en: mBio, Edición 11/5, 2020, ISSN 2150-7511
Editor: American Society for Microbiology
DOI: 10.1128/mbio.02371-20

Genome wide transcriptomic analysis of the soil ammonia oxidizing archaeon Nitrososphaera viennensis upon exposure to copper limitation

Autores: Carolina Reyes, Logan H. Hodgskiss, Melina Kerou, Thomas Pribasnig, Sophie S. Abby, Barbara Bayer, Stephan M. Kraemer, Christa Schleper
Publicado en: The ISME Journal, Edición 14/11, 2020, Página(s) 2659-2674, ISSN 1751-7362
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41396-020-0715-2

CRISPR-mediated gene silencing reveals involvement of the archaeal S-layer in cell division and virus infection

Autores: Isabelle Anna Zink, Kevin Pfeifer, Erika Wimmer, Uwe B. Sleytr, Bernhard Schuster, Christa Schleper
Publicado en: Nature Communications, Edición 10/1, 2019, ISSN 2041-1723
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-019-12745-x

Nitrogen Isotope Fractionation During Archaeal Ammonia Oxidation: Coupled Estimates From Measurements of Residual Ammonium and Accumulated Nitrite

Autores: Maria Mooshammer, Ricardo J. E. Alves, Barbara Bayer, Michael Melcher, Michaela Stieglmeier, Lara Jochum, Simon K.-M. R. Rittmann, Margarete Watzka, Christa Schleper, Gerhard J. Herndl, Wolfgang Wanek
Publicado en: Frontiers in Microbiology, Edición 1664302X, 2020, ISSN 1664-302X
Editor: Frontiers Media
DOI: 10.3389/fmicb.2020.01710

A phylogenetic and proteomic reconstruction of eukaryotic chromatin evolution

Autores: Xavier Grau-Bové, Cristina Navarrete, Cristina Chiva, Thomas Pribasnig, Meritxell Antó, Guifré Torruella, Luis Javier Galindo, Bernd Franz Lang, David Moreira, Purificación López-Garcia, Iñaki Ruiz-Trillo, Christa Schleper, Eduard Sabidó & Arnau Sebé-Pedrós
Publicado en: Nature Ecology & Evolution, Edición 6, 2022, Página(s) 1007-1023, ISSN 2397-334X
Editor: Nature Ecology & Evolution
DOI: 10.1038/s41559-022-01771-6

Proteomics and comparative genomics of Nitrososphaera viennensis reveal the core genome and adaptations of archaeal ammonia oxidizers

Autores: Melina Kerou, Pierre Offre, Luis Valledor, Sophie S. Abby, Michael Melcher, Matthias Nagler, Wolfram Weckwerth, Christa Schleper
Publicado en: Proceedings of the National Academy of Sciences, Edición 113/49, 2016, Página(s) E7937-E7946, ISSN 0027-8424
Editor: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.1601212113

Chemotaxonomic characterisation of the thaumarchaeal lipidome

Autores: Felix J. Elling, Martin Könneke, Graeme W. Nicol, Michaela Stieglmeier, Barbara Bayer, Eva Spieck, José R. de la Torre, Kevin W. Becker, Michael Thomm, James I. Prosser, Gerhard J. Herndl, Christa Schleper, Kai-Uwe Hinrichs
Publicado en: Environmental Microbiology, Edición 19/7, 2017, Página(s) 2681-2700, ISSN 1462-2912
Editor: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/1462-2920.13759

Unifying the global phylogeny and environmental distribution of ammonia-oxidising archaea based on amoA genes

Autores: Ricardo J. Eloy Alves, Bui Quang Minh, Tim Urich, Arndt von Haeseler, Christa Schleper
Publicado en: Nature Communications, Edición 9/1, 2018, ISSN 2041-1723
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-018-03861-1

Candidatus Nitrosocaldus cavascurensis, an Ammonia Oxidizing, Extremely Thermophilic Archaeon with a Highly Mobile Genome

Autores: Sophie S. Abby, Michael Melcher, Melina Kerou, Mart Krupovic, Michaela Stieglmeier, Claudia Rossel, Kevin Pfeifer, Christa Schleper
Publicado en: Frontiers in Microbiology, Edición 9, 2018, ISSN 1664-302X
Editor: Frontiers Media
DOI: 10.3389/fmicb.2018.00028

Ammonia Oxidation by the Arctic Terrestrial Thaumarchaeote Candidatus Nitrosocosmicus arcticus Is Stimulated by Increasing Temperatures

Autores: Ricardo J. Eloy Alves, Melina Kerou, Anna Zappe, Romana Bittner, Sophie S. Abby, Heiko A. Schmidt, Kevin Pfeifer, Christa Schleper
Publicado en: Frontiers in Microbiology, Edición 10, 2019, ISSN 1664-302X
Editor: Frontiers Media
DOI: 10.3389/fmicb.2019.01571

Metagenomes from Coastal Marine Sediments Give Insights into the Ecological Role and Cellular Features of Loki - and Thorarchaeota

Autores: Lokeshwaran Manoharan, Jessica A. Kozlowski, Robert W. Murdoch, Frank E. Löffler, Filipa L. Sousa, Christa Schleper
Publicado en: mBio, Edición 10/5, 2019, ISSN 2150-7511
Editor: ASM
DOI: 10.1128/mbio.02039-19

Heavily Armed Ancestors: CRISPR Immunity and Applications in Archaea with a Comparative Analysis of CRISPR Types in Sulfolobales

Autores: Isabelle Anna Zink, Erika Wimmer, Christa Schleper
Publicado en: Biomolecules, Edición 10/11, 2020, Página(s) 1523, ISSN 2218-273X
Editor: MDPI
DOI: 10.3390/biom10111523

Microbial diversity of a closed salt lagoon in the Puertecitos area, Upper Gulf of California

Autores: Jessica A Kozlowski, Markes E Johnson, Jorge Ledesma-Vasquez, Daniel Birgel, Jörn Peckmann, Christa Schleper
Publicado en: Ciencias Marinas, Edición 44/2, 2018, Página(s) 71-90, ISSN 2395-9053
Editor: Ciencias Marinas
DOI: 10.7773/cm.v44i2.2825

Linking 16S rRNA Gene Classification to amoA Gene Taxonomy Reveals Environmental Distribution of Ammonia-Oxidizing Archaeal Clades in Peatland Soils

Autores: Haitao Wang, Alexandre Bagnoud, Rafael I. Ponce-Toledo, Melina Kerou, Micha Weil, Christa Schleper, Tim Urich
Publicado en: mSystems, Edición 23795077, 2021, Página(s) e00546-21, ISSN 2379-5077
Editor: American Society for Microbiology
DOI: 10.1128/msystems.00546-21

Comparative Proteomics of Three Species of Ammonia-Oxidizing Bacteria

Autores: Jackie K. Zorz, Jessica A. Kozlowski, Lisa Y. Stein, Marc Strous, Manuel Kleiner
Publicado en: Frontiers in Microbiology, Edición 1664302X, 2018, ISSN 1664-302X
Editor: Frontiers Media
DOI: 10.3389/fmicb.2018.00938

Genomes of Thaumarchaeota from deep sea sediments reveal specific adaptations of three independently evolved lineages.

Autores: Melina Kerou, Rafael I. Ponce-Toledo, Rui Zhao, Sophie S. Abby, Miho Hirai, Hidetaka Nomaki, Yoshihiro Takaki, Takuro Nunoura, Steffen L. Jørgensen & Christa Schleper
Publicado en: Genomes of Thaumarchaeota from deep sea sediments reveal specific adaptations of three independently evolved lineages, Edición 15, 2021, Página(s) 2792-2808, ISSN 1751-7370
Editor: The ISME Journal (ISME J)
DOI: 10.1038/s41396-021-00962-6