Objetivo
Many studies of global gene expression focus solely on studying the transcriptome thereby only assessing mRNA abundance. However, transcription is only a single layer of gene expression and recently, the influence of post-transcriptional regulation has become undeniable. Rather underrepresented players in post-transcriptional control are G-quadruplexes (G4s). These stable structures can form guanine tetrads in DNA and RNA via p-p-stacking of several planar arrangements of four guanine bases stabilized by Hoogsteen hydrogen bonds and a central metal cation. Recent reports have pointed to an important regulatory role of G4 motives in key cellular functions including pre-mRNA processing, RNA turnover, mRNA transport thereby suggesting intriguing links to human diseases as cancer and neurological disorders. G4 structures in mRNAs seem to act as signaling components that constitute an own post-transcriptional operon. Recruitment of G4-specific RBPs then determines the ultimate fate of G4-containing mRNAs. Not many RBPs or upstream regulatory factors of G4s have been identified and the functional consequences of these interactions are not known. In this proposal I will address these questions. First, I will identify mRNAs that are differentially translated and/or stabilized in the presence of the G4 specific ligand pyridostatin (PDS), which stabilizes G4 structures. The resulting comprehensive list of mRNAs will be the first data set that provides a mechanistically link of G4 motive regulation. Secondly, I will identify factors in the G4 regulatory network using a genome wide shRNA assay to determine proteins that modulate the stability and/or the translation of G4 motive containing mRNAs. It is important to understand G4 structure-function relationships and upstream regulatory processes as the emerging link between G4 formation and human disease opens up an exciting research direction that has potential implications for therapeutic intervention.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales ciencias biológicas bioquímica biomoléculas proteínas
- ciencias naturales ciencias biológicas genética ARN transcriptomas
- ciencias médicas y de la salud medicina clínica oncología
- ciencias médicas y de la salud medicina básica neurología
- ciencias naturales ciencias biológicas genética genoma
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Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
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H2020-EU.1.3. - EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions
PROGRAMA PRINCIPAL
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H2020-EU.1.3.2. - Nurturing excellence by means of cross-border and cross-sector mobility
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Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
MSCA-IF-EF-ST - Standard EF
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Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
(se abrirá en una nueva ventana) H2020-MSCA-IF-2015
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Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.
CB2 1TN CAMBRIDGE
Reino Unido
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.