Decoding the molecular mechanisms driving host adaptation of yellow rust on cereal crops and grasses

Informations projet

DeMMYR

N° de convention de subvention: 715638

DOI

10.3030/715638

Projet clôturé

Date de signature de la CE 17 Octobre 2016

Date de début 1 Mars 2017

Date de fin 28 Février 2023

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coût total

€ 1 714 779,00

Contribution de l’UE

€ 1 714 779,00

Coordonné par

JOHN INNES CENTRE
United Kingdom

CORDIS fournit des liens vers les livrables publics et les publications des projets HORIZON.

Les liens vers les livrables et les publications des projets du 7e PC, ainsi que les liens vers certains types de résultats spécifiques tels que les jeux de données et les logiciels, sont récupérés dynamiquement sur OpenAIRE .

Livrables

Open Research Data Pilot (1)

Data management plan

The Data Management Plan will determine and explain which of the research data will be made open.

Publications

Peer reviewed articles (15)

Rust expression browser: an open source database for simultaneous analysis of host and pathogen gene expression profiles with expVIP

Auteurs: Thomas M. Adams, Tjelvar S. G. Olsson, Ricardo H. Ramírez-González, Ruth Bryant, Rosie Bryson, Pablo Eduardo Campos, Paul Fenwick, David Feuerhelm, Charlotte Hayes, Tina Henriksson, Amelia Hubbard, Radivoje Jevtić, Christopher Judge, Matthew Kerton, Jacob Lage, Clare M. Lewis, Christine Lilly, Udi Meidan, Dario Novoselović, Colin Patrick, Ruth Wanyera, Diane G. O. Saunders
Publié dans: BMC Genomics, Numéro 22/1, 2021, ISSN 1471-2164
Éditeur: BioMed Central
DOI: 10.1186/s12864-021-07488-3

Pathogenomic analyses of Puccinia striiformis f. sp. tritici supports a close genetic relationship between South and East Africa

Auteurs: Hester van Schalkwyk, Antoine Persoons, Thomas Adams, Anne-marie F. Justesen, Ruth Wanyera, Mogens S. Hovmøller, Cristobal Uauy, Lesley Boyd, Zak A. Pretorius, Renee Prins, Diane G.O. Saunders
Publié dans: Plant Pathology, 2021, ISSN 1365-3059
Éditeur: BSPP
DOI: 10.1111/ppa.13468

Aeciospore ejection in the rust pathogen Puccinia graminis is driven by moisture ingress

Auteurs: Vanessa Bueno-Sancho, Elizabeth S. Orton, Morgan Gerrity, Clare M. Lewis, Phoebe Davey, Kim C. Findlay, Elaine Barclay, Phil Robinson, Richard J. Morris, Mark Blyth, Diane G. O. Saunders
Publié dans: Communications Biology, Numéro 4/1, 2021, ISSN 2399-3642
Éditeur: Nature
DOI: 10.1038/s42003-021-02747-1

Wheat stem rust recorded for the first time in decades in Ireland

Auteurs: Ayako Tsushima; Clare M. Lewis; Kerstin Flath; Stephen Kildea; Diane G. O. Saunders
Publié dans: Plant Pathology, Numéro 71/4, 2022, Page(s) 890-900, ISSN 1365-3059
Éditeur: Wiley
DOI: 10.1111/ppa.13532

Banishing barberry: The history of Berberis vulgaris prevalence and wheat stem rust incidence across Britain

Auteurs: Gerry Barnes; Diane G. O. Saunders; Tom Williamson
Publié dans: Plant Pathology, Numéro 69, 2020, Page(s) 1193-1202, ISSN 1365-3059
Éditeur: Wiley
DOI: 10.1111/ppa.13231

Potential for re-emergence of wheat stem rust in the United Kingdom

Auteurs: Clare M. Lewis, Antoine Persoons, Daniel P. Bebber, Rose N. Kigathi, Jens Maintz, Kim Findlay, Vanessa Bueno-Sancho, Pilar Corredor-Moreno, Sophie A. Harrington, Ngonidzashe Kangara, Anna Berlin, Richard García, Silvia E. Germán, Alena Hanzalová, David P. Hodson, Mogens S. Hovmøller, Julio Huerta-Espino, Muhammed Imtiaz, Javed Iqbal Mirza, Annemarie F. Justesen, Rients E. Niks, Ali Omrani, Meh
Publié dans: Communications Biology, Numéro 1/1, 2018, ISSN 2399-3642
Éditeur: Springer Nature
DOI: 10.1038/s42003-018-0013-y

Stem rust ( Puccina graminis ) identified on spring barley in the UK adjacent to infected Berberis vulgaris

Auteurs: E.S. Orton, C.M. Lewis, P.E. Davey, G.V. Radhakrishnan, D.G.O. Saunders
Publié dans: New Disease Reports, Numéro 40, 2019, Page(s) 11, ISSN 2044-0588
Éditeur: BSPP
DOI: 10.5197/j.2044-0588.2019.040.011

MARPLE, a point-of-care, strain-level disease diagnostics and surveillance tool for complex fungal pathogens

Auteurs: Guru V. Radhakrishnan, Nicola M. Cook, Vanessa Bueno-Sancho, Clare M. Lewis, Antoine Persoons, Abel Debebe Mitiku, Matthew Heaton, Phoebe E. Davey, Bekele Abeyo, Yoseph Alemayehu, Ayele Badebo, Marla Barnett, Ruth Bryant, Jeron Chatelain, Xianming Chen, Suomeng Dong, Tina Henriksson, Sarah Holdgate, Annemarie F. Justesen, Jay Kalous, Zhensheng Kang, Szymon Laczny, Jean-Paul Legoff, Driecus Lesch,
Publié dans: BMC Biology, Numéro 17/1, 2019, ISSN 1741-7007
Éditeur: BioMed Central
DOI: 10.1186/s12915-019-0684-y

First Report of Puccinia striiformis f. sp. tritici , Causing Stripe Rust of Wheat, in Zimbabwe

Auteurs: Willem H.P. Boshoff, Botma Visser, Clare Lewis, Thomas Michael Adams, Diane Saunders, Tarekegn Terefe, Tegwe Soko, Nyasha Chuiraise, Zacharias A. Pretorius
Publié dans: Plant Disease, 2019, ISSN 0191-2917
Éditeur: American Phytopathological Society
DOI: 10.1094/pdis-07-19-1395-pdn

A global surveillance system for crop diseases

Auteurs: M. Carvajal-Yepes, K. Cardwell, A. Nelson, K. A. Garrett, B. Giovani, D. G. O. Saunders, S. Kamoun, J. P. Legg, V. Verdier, J. Lessel, R. A. Neher, R. Day, P. Pardey, M. L. Gullino, A. R. Records, B. Bextine, J. E. Leach, S. Staiger, J. Tohme
Publié dans: Science, Numéro 364/6447, 2019, Page(s) 1237-1239, ISSN 0036-8075
Éditeur: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/science.aaw1572

Expecting the unexpected: factors influencing the emergence of fungal and oomycete plant pathogens

Auteurs: Pilar Corredor‐Moreno, Diane G. O. Saunders
Publié dans: New Phytologist, 2019, ISSN 0028-646X
Éditeur: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/nph.16007

Pathogenomic Analysis of Wheat Yellow Rust Lineages Detects Seasonal Variation and Host Specificity

Auteurs: Vanessa Bueno-Sancho, Antoine Persoons, Amelia Hubbard, Luis Enrique Cabrera-Quio, Clare M Lewis, Pilar Corredor-Moreno, Daniel C E Bunting, Sajid Ali, Soonie Chng, David P Hodson, Ricardo Madariaga Burrows, Rosie Bryson, Jane Thomas, Sarah Holdgate, Diane G O Saunders
Publié dans: Genome Biology and Evolution, Numéro 9/12, 2017, Page(s) 3282-3296, ISSN 1759-6653
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/gbe/evx241

High frequency of fungicide resistance‐associated mutations in the wheat yellow rust pathogen Puccinia striiformis f. sp. tritici

Auteurs: Nicola M Cook, Soonie Chng, Tamsin L Woodman, Rachael Warren, Richard P Oliver, Diane GO Saunders
Publié dans: Pest Management Science, Numéro 77/7, 2021, Page(s) 3358-3371, ISSN 1526-498X
Éditeur: John Wiley & Sons Inc.
DOI: 10.1002/ps.6380

Magnaporthe oryzae pathotype Triticum (MoT) can act as a heterologous expression system for fungal effectors with high transcript abundance in wheat

Auteurs: Cassandra Jensen; Diane G. O. Saunders
Publié dans: Scientific Reports, Numéro 13/108, 2023, ISSN 2045-2322
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-022-27030-z

The branched-chain amino acid aminotransferase TaBCAT1 modulates amino acid metabolism and positively regulates wheat rust susceptibility

Auteurs: Pilar Corredor-Moreno, Francesca Minter, Phoebe E Davey, Eva Wegel, Baldeep Kular, Paul Brett, Clare M Lewis, Yvie M L Morgan, Luis A Macías Pérez, Andrey V Korolev, Lionel Hill, Diane G O Saunders
Publié dans: The Plant Cell, Numéro 33/5, 2021, Page(s) 1728-1747, ISSN 1040-4651
Éditeur: American Society of Plant Biologists
DOI: 10.1093/plcell/koab049

Other (3)

Tracking wheat yellow rust: near real-time data sharing with Nextstrain

Auteurs: Thomas M. Adams; Richard A. Neher; Diane G. O. Saunders
Publié dans: Zenodo, 2020
Éditeur: Zenodo
DOI: 10.5281/zenodo.3758078

K-PIE: using K-means algorithm for Percentage Infection symptoms Estimation

Auteurs: Vanessa Bueno-Sancho; Pilar Corredor-Moreno; Ngonidzashe Kangara; Diane G.O. Saunders
Publié dans: Zenodo, 2019
Éditeur: Zenodo
DOI: 10.5281/zenodo.3584148

Additional file 2 of Rust expression browser: an open source database for simultaneous analysis of host and pathogen gene expression profiles with expVIP

Auteurs: Adams, Thomas M.; Tjelvar S. G. Olsson; Ramírez-González, Ricardo H.; Bryant, Ruth; Bryson, Rosie; Campos, Pablo Eduardo; Fenwick, Paul; Feuerhelm, David; Hayes, Charlotte; Henriksson, Tina; Hubbard, Amelia; Jevtić, Radivoje; Judge, Christopher; Kerton, Matthew; Lage, Jacob; Lewis, Clare M.; Lilly, Christine; Meidan, Udi; Novoselović, Dario; Patrick, Colin; Wanyera, Ruth; Saunders, Diane G. O.
Publié dans: Figshare, 2020
Éditeur: Figshare
DOI: 10.6084/m9.figshare.14189978.v1

Non-peer reviewed articles (1)

Tackling the re-emergence of wheat stem rust in Western Europe

Auteurs: Diane G. O. Saunders, Zacharias A. Pretorius, Mogens S. Hovmøller
Publié dans: Communications Biology, Numéro 2/1, 2019, ISSN 2399-3642
Éditeur: Nature
DOI: 10.1038/s42003-019-0294-9