Functional genomics in Schizophyllum commune: leveraging the diversity in this hypervariable fungus to understand mushroom development

Informations projet

Mushroomics

N° de convention de subvention: 716132

DOI 10.3030/716132

Projet clôturé

Date de signature de la CE 29 Novembre 2016

Date de début 1 Janvier 2017

Date de fin 31 Decembre 2022

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coût total € 1 500 000,00

Contribution de l’UE € 1 500 000,00

Coordonné par

UNIVERSITEIT UTRECHT
Netherlands

Publications

Peer reviewed articles (6)

The Transcription Factor Roc1 Is a Key Regulator of Cellulose Degradation in the Wood-Decaying Mushroom Schizophyllum commune

Auteurs: Ioana M. Marian, Peter Jan Vonk, Ivan D. Valdes, Kerrie Barry, Benedict Bostock, Akiko Carver, Chris Daum, Harry Lerner, Anna Lipzen, Hongjae Park, Margo B. P. Schuller, Martin Tegelaar, Andrew Tritt, Jeremy Schmutz, Jane Grimwood, Luis G. Lugones, In-Geol Choi, Han A. B. Wösten, Igor V. Grigoriev, Robin A. Ohm
Publié dans: mBio, Numéro 13/3, 2022, ISSN 2150-7511
Éditeur: ASM
DOI: 10.1128/mbio.00628-22

The regulatory network of the White Collar complex during early mushroom development in Schizophyllum commune

Auteurs: Peter Jan Vonk, Marieke J.P. van der Poel, Zoé E. Niemeijer, Robin A. Ohm
Publié dans: Microbiological Research, Numéro 284, 2024, Page(s) 127736, ISSN 0944-5013
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.micres.2024.127736

H3K4me2 ChIP-Seq reveals the epigenetic landscape during mushroom formation and novel developmental regulators of Schizophyllum commune

Auteurs: Peter Jan Vonk, Robin A. Ohm
Publié dans: Scientific Reports, Numéro 11/1, 2021, ISSN 2045-2322
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-021-87635-8

The role of homeodomain transcription factors in fungal development

Auteurs: Peter Jan Vonk, Robin A. Ohm
Publié dans: Fungal Biology Reviews, 2018, ISSN 1749-4613
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.fbr.2018.04.002

Transcriptomic atlas of mushroom development reveals conserved genes behind complex multicellularity in fungi

Auteurs: Krisztina Krizsán, Éva Almási, Zsolt Merényi, Neha Sahu, Máté Virágh, Tamás Kószó, Stephen Mondo, Brigitta Kiss, Balázs Bálint, Ursula Kües, Kerrie Barry, Judit Cseklye, Botond Hegedüs, Bernard Henrissat, Jenifer Johnson, Anna Lipzen, Robin A. Ohm, István Nagy, Jasmyn Pangilinan, Juying Yan, Yi Xiong, Igor V. Grigoriev, David S. Hibbett, László G. Nagy
Publié dans: Proceedings of the National Academy of Sciences, Numéro 116/15, 2019, Page(s) 7409-7418, ISSN 0027-8424
Éditeur: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.1817822116

High-throughput targeted gene deletion in the model mushroom Schizophyllum commune using pre-assembled Cas9 ribonucleoproteins

Auteurs: Peter Jan Vonk, Natalia Escobar, Han A. B. Wösten, Luis G. Lugones, Robin A. Ohm
Publié dans: Scientific Reports, Numéro 9/1, 2019, ISSN 2045-2322
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-019-44133-2

Thesis and dissertations (1)

Functional Genomics in Schizophyllum commune

Auteurs: Peter Jan Vonk
Publié dans: 2022, ISBN 9789039374566
Éditeur: Utrecht University
DOI: 10.33540/1035