Objectif
The evolution of specificity between interacting biological molecules underlies the diversification and expansion of biological pathways. A shift in specificity poses a serious theoretical problem; it requires coordinated mutations in the interacting partners, but mutation in one partner may lead to loss of interaction and functional failure. While some theoretical suggestions were proposed to solve this 'specificity valley crossing' problem, it remains a challenge to study this problem empirically at the molecular level. In bacteria, there are numerous divergent evolving pathways. Many of these pathways are involved in mediating conflicts between selfish genes, cells and populations. We and others have speculated that such multilevel selection can facilitate pathway divergence. Here we propose to study this link using the Rap-Phr cell-cell communication system, which has diversified to ~100 specific systems in the B. subtilis lineage. These systems consist of a receptor (Rap) and its cognate peptide pheromone (Phr) that influence multiple levels of selection. They promote their own horizontal transfer, modulate core cellular pathways, and manipulate cooperation between cells. Combining modelling with deep mutational scanning, competition assays and time-lapse microscopy we will quantitatively study all these levels of selection and their implication for diversification on a large fitness landscape. Specifically, we will (1) map the Rap-Phr interaction landscape at unprecedented resolution, constructing and screening libraries of ~106 Phr peptide variants and ~104 Rap variants. (2) Quantify the fitness effects of these systems at multiple levels of selection in biofilms. (3) Theoretically generate and experimentally verify predictions about how Rap-Phr co-evolve and diversify. Our work will pioneer the study of fitness landscapes under multilevel selection and provide a direct, quantitative, and predictive framework for understanding the evolution of specificity.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques microbiologie bactériologie
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule
- sciences naturelles sciences physiques optique microscopie
- sciences naturelles sciences biologiques génétique mutation
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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H2020-EU.1.1. - EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
ERC-COG - Consolidator Grant
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
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(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) ERC-2016-COG
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
69978 Tel Aviv
Israël
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.