Objectif
The basis for this project consists in a mathematical framework previously developed by the applicant that allows to describe graph rewriting systems algebraically, the so-called rule algebraic framework. In order to advance and valorise the concept, this project proposes to develop a general concept for rule-algebraic simple rewriting (RaSiR), both for conventional graph rewriting and for a novel form of simplicial rewriting. Secondly, RaSiR will serve as the basis for developing rule-algebraic variants of trace compression and observable-update algorithms for the rewriting system Kappa. The final aim of the project consists in developing and implementing the so-called observable-centric bootstrapping algorithm (OCBA) as a module for the simulation suite KaSim for the Kappa language. Kappa is predominantly used for simulating biochemical reaction systems, which typically display an extremely high combinatorial complexity. The algorithms and software modules developed in this project will provide in particular an alternative to pure stochastic simulation via the SSA algorithm as currently implemented in KaSim, in the form of the OCBA module. This module will admit the generation of approximate observable distributions from individual pure states of the system by calculating algebraically truncations of the formal solution of the chemical master equation as well as the induced observable update functions. The project shall be hosted by Dr. Jean Krivine of the PPS team at IRIF at the University Paris-Diderot in France. Dr. Krivine is one of the two main developers of the KaSim simulation suite, and moreover one of the world experts in the theoretical and practical development of the programming language Kappa. IRIF will provide an ideal environment for the applicant to develop new skills, to be part the very interdisciplinary research team PPS, and to communicate and valorise the project results to the greater biochemical and systems biological simulation community.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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H2020-EU.1.3. - EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions
PROGRAMME PRINCIPAL
Voir tous les projets financés dans le cadre de ce programme -
H2020-EU.1.3.2. - Nurturing excellence by means of cross-border and cross-sector mobility
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
MSCA-IF-EF-ST - Standard EF
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) H2020-MSCA-IF-2016
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
75006 PARIS
France
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.