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Bringing the paradigm for marine pelagic production into the 21st century: incorporating mixotrophy into mainstream marine research

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Open access peer reviewed publications in international journals

Open access peer reviewed publications in international journals mo30 and on

Presentation of results in international scientific conferences

Presentation of results in international scientific conferences mo30 and on

MixITiN symposium

Midproject symposium including visiting scientists

MixITiN Conference

International conference

Public and media engagement interactions

Public and media engagement interactions (mo.12 and on)

MixITiN website and social networking launch

MixITiN website and social networking launched with regular and frequent updating over project life

Publications

Isolation of clean single-cell samples for physiological or molecular experiments (Radiolaria, Acantharia) V.2

Auteurs: Joost S Mansour, Fabrice Not
Publié dans: protocols.io, 2021
Éditeur: protocols.io
DOI: 10.17504/protocols.io.bqvrmw56

Interpretative toolkit to enable the use of genomic data aligned with physiological status for representative mixoplankton.

Auteurs: Anestis A, Mansour JS, Maselli M, Hansen PJ, Not F, John U
Publié dans: Zenodo, 2021
Éditeur: Zenodo
DOI: 10.5281/zenodo.5520905

HABs and the Mixoplankton Paradigm

Auteurs: Mitra A, Flynn KJ
Publié dans: UNESCO Harmful Algae News, Numéro 67, 2021, Page(s) 4-6
Éditeur: Zenodo
DOI: 10.5281/zenodo.5109703

Single-cell total RNA extraction from marine protists (e.g. Acantharia, Strombidium cf basimorphum, and Prymnesium parvum) V.2

Auteurs: Joost S Mansour, Konstantinos Anestis, Fabrice Not, Uwe John
Publié dans: protocols.io, 2021
Éditeur: protocols.io
DOI: 10.17504/protocols.io.bp6xmrfn

cDNA library preparation from total RNA extracts of Single-cell marine protists (e.g. Acantharia, Strombidium basimorphum, and Prymnesium parvum) for transcriptome sequencing V.3

Auteurs: Joost S Mansour, Konstantinos Anestis, Fabrice Not, Uwe John
Publié dans: protocols.io, 2021
Éditeur: protocols.io
DOI: 10.17504/protocols.io.brw3m7gn

Mixoplankton International Workshop Report.

Auteurs: Flynn KJ, Mitra A, Glibert P, Smyth T
Publié dans: Zenodo, 2021
Éditeur: Zenodo
DOI: 10.5281/zenodo.5521009

Exploring the Trophic Spectrum: Placing Mixoplankton Into Marine Protist Communities of the Southern North Sea

Auteurs: Lisa K. Schneider, Kevin J. Flynn, Peter M. J. Herman, Tineke A. Troost, Willem Stolte
Publié dans: Frontiers in Marine Science, Numéro 7, 2020, ISSN 2296-7745
Éditeur: Frontiers
DOI: 10.3389/fmars.2020.586915

The strengths and weaknesses of Live Fluorescently Labelled Algae (LFLA) to estimate herbivory in protozooplankton and mixoplankton

Auteurs: Guilherme Duarte Ferreira, Joana Figueira, Sónia Cotrim Marques, Per Juel Hansen, Albert Calbet
Publié dans: Marine Environmental Research, Numéro 174, 2022, ISSN 0141-1136
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.marenvres.2022.105558

Polyketide synthase genes and molecular trade-offs in the ichthyotoxic species Prymnesium parvum.

Auteurs: Anestis K, Kohli GS, Wohlrab S, Varga E, Larsen TO, Hansen PJ, John U
Publié dans: Science of Total Environment, 2021, ISSN 0048-9697
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.scitotenv.2021.148878

Temporal Variability of Planktonic Ciliates in a Coastal Oligotrophic Environment: Mixotrophy, Size Classes and Vertical Distribution

Auteurs: Filomena Romano, Katerina Symiakaki, Paraskevi Pitta
Publié dans: Frontiers in Marine Science, Numéro 8, 2021, ISSN 2296-7745
Éditeur: Frontiers Media SA
DOI: 10.3389/fmars.2021.641589

From webs, loops, shunts, and pumps to microbial multitasking: Evolving concepts of marine microbial ecology, the mixoplankton paradigm, and implications for a future ocean

Auteurs: Patricia M Glibert & Aditee Mitra
Publié dans: Limnology and Oceanography, 2022, ISSN 1939-5590
Éditeur: Wiley
DOI: 10.1002/lno.12018

Drivers of the variability of dimethylsulfonioproprionate (DMSP) and dimethylsulfoxide (DMSO) in the Southern North Sea

Auteurs: Royer C, Borges AV, Lapeyra Martin J, Gypens N
Publié dans: Continental Shelf Research, Numéro 216, 2021, Page(s) 104360, ISSN 0278-4343
Éditeur: Pergamon Press Ltd.
DOI: 10.1016/j.csr.2021.104360

Niche separation between different functional types of mixoplankton: results from NPZ-style N-based model simulations

Auteurs: Anna-A Anschütz, Kevin J. Flynn
Publié dans: Marine Biology, Numéro 167/1, 2020, ISSN 0025-3162
Éditeur: Springer Verlag
DOI: 10.1007/s00227-019-3612-3

Carbon and nitrogen content to biovolume relationships for marine protist of the Rhizaria lineage (Radiolaria and Phaeodaria)

Auteurs: Joost Samir Mansour; Andreas Norlin; Natalia Llopis Monferrer; Stéphane L'Helguen; Fabrice Not
Publié dans: Limnology And Oceanography, 2021, Page(s) 1703-1717, ISSN 1536-3538
Éditeur: Wiley
DOI: 10.1002/lno.11714

Caveats on the use of rotenone to estimate mixotrophic grazing in the oceans

Auteurs: Guilherme D. Ferreira, Albert Calbet
Publié dans: Scientific Reports, Numéro 10/1, 2020, ISSN 2045-2322
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-020-60764-2

Relationships of pelagic ciliates with the microbial food web components at a coastal station in the oligotrophic Eastern Mediterranean Sea: temporal and vertical variability

Auteurs: Filomena Romano, Paraskevi Pitta
Publié dans: Journal of Plankton Research, Numéro 43/5, 2021, Page(s) 691-711, ISSN 0142-7873
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/plankt/fbab053

The coupling between irradiance, growth, photosynthesis and prymnesin cell quota and production in two strains of the bloom-forming haptophyte, Prymnesium parvum

Auteurs: Nikola Medic, Elisabeth Varga, Dedmer B. Van de Waal, Thomas Ostenfeld Larsen, Per Juel Hansen
Publié dans: Harmful Algae, Numéro 112, 2022, Page(s) 8, ISSN 1568-9883
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.hal.2022.102173

Effects of prey trophic mode on the gross-growth efficiency of marine copepods: the case of mixoplankton

Auteurs: Claudia Traboni, Albert Calbet, Enric Saiz
Publié dans: Scientific Reports, Numéro 10/1, 2020, ISSN 2045-2322
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-020-69174-w

Development of an Indirect Quantitation Method to Assess Ichthyotoxic B-Type Prymnesins from Prymnesium parvum

Auteurs: Daniel Killerup Svenssen, Sofie Bjørnholt Binzer, Nikola Medić, Per Juel Hansen, Thomas Ostenfeld Larsen, Elisabeth Varga
Publié dans: Toxins, Numéro 11/5, 2019, Page(s) 251, ISSN 2072-6651
Éditeur: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/toxins11050251

Mixotrophic protists and a new paradigm for marine ecology: where does plankton research go now?

Auteurs: Kevin J Flynn, Aditee Mitra, Konstantinos Anestis, Anna A Anschütz, Albert Calbet, Guilherme Duarte Ferreira, Nathalie Gypens, Per J Hansen, Uwe John, Jon Lapeyra Martin, Joost S Mansour, Maira Maselli, Nikola Medić, Andreas Norlin, Fabrice Not, Paraskevi Pitta, Filomena Romano, Enric Saiz, Lisa K Schneider, Willem Stolte, Claudia Traboni
Publié dans: Journal of Plankton Research, 2019, ISSN 0142-7873
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/plankt/fbz026

Modeling mixoplankton along the biogeochemical gradient of the Southern North Sea

Auteurs: Lisa K. Schneider, Nathalie Gypens, Tineke A. Troost, Willem Stolte
Publié dans: Ecological Modelling, Numéro 459, 2021, Page(s) 109690, ISSN 0304-3800
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.ecolmodel.2021.109690

Ecophysiological traits of mixotrophic Strombidium spp

Auteurs: Maira Maselli, Andreas Altenburger, Diane K Stoecker, Per Juel Hansen
Publié dans: Journal of Plankton Research, Numéro 42/5, 2020, Page(s) 485-496, ISSN 0142-7873
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/plankt/fbaa041

Retention of Prey Genetic Material by the Kleptoplastidic Ciliate Strombidium cf. basimorphum

Auteurs: Maira Maselli, Konstantinos Anestis, Kerstin Klemm, Per Juel Hansen, Uwe John
Publié dans: Frontiers in Microbiology, Numéro 12, 2021, Page(s) 8, ISSN 1664-302X
Éditeur: Frontiers Media
DOI: 10.3389/fmicb.2021.694508

Differences in physiology explain succession of mixoplankton functional types and affect carbon fluxes in temperate seas

Auteurs: Suzana Gonçalves Leles, Jorn Bruggeman, Luca Polimene, Jerry Blackford, Kevin J Flynn, Aditee Mitra
Publié dans: Progress in Oceanography, Numéro 190, 2021, Page(s) 102481, ISSN 0079-6611
Éditeur: Pergamon Press Ltd.
DOI: 10.1016/j.pocean.2020.102481

Metabolic Reliance on Photosynthesis Depends on Both Irradiance and Prey Availability in the Mixotrophic Ciliate, Strombidium cf. basimorphum

Auteurs: Erin Ann Hughes, Maira Maselli, Helle Sørensen, Per Juel Hansen
Publié dans: Frontiers in Microbiology, Numéro 12, 2021, Page(s) 12, ISSN 1664-302X
Éditeur: Frontiers Media
DOI: 10.3389/fmicb.2021.642600

Response of marine methane dissolved concentrations and emissions in the Southern North Sea to the European 2018 heatwave

Auteurs: A.V. Borges, C. Royer, J. Lapeyra Martin, W. Champenois, N. Gypens
Publié dans: Continental Shelf Research, Numéro 190, 2019, Page(s) 104004, ISSN 0278-4343
Éditeur: Pergamon Press Ltd.
DOI: 10.1016/j.csr.2019.104004

A dataset on trophic modes of aquatic protists

Auteurs: Lisa Schneider, Konstantinos Anestis, Joost Mansour, Anna Anschütz, Nathalie Gypens, Per Hansen, Uwe John, Kerstin Klemm, Jon Martin, Nikola Medic, Fabrice Not, Willem Stolte
Publié dans: Biodiversity Data Journal, Numéro 8, 2020, ISSN 1314-2828
Éditeur: Pensoft
DOI: 10.3897/bdj.8.e56648

Mixotrophy upgrades food quality for marine calanoid copepods

Auteurs: Claudia Traboni; Albert Calbet; Enric Saiz
Publié dans: Limnology and Oceanography, Numéro 66, 2021, Page(s) 4125–4139, ISSN 1939-5590
Éditeur: Wiley
DOI: 10.1002/lno.11948

Exploring evolution of maximum growth rates in plankton

Auteurs: Kevin J Flynn, David O F Skibinski
Publié dans: Journal of Plankton Research, Numéro 42/5, 2020, Page(s) 497-513, ISSN 0142-7873
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/plankt/fbaa038

Eco-Evolutionary Perspectives on Mixoplankton

Auteurs: Mansour JS, Anestis K
Publié dans: Frontiers in Marine Science, 2021, Page(s) 597, ISSN 2296-7745
Éditeur: Frontiers
DOI: 10.3389/fmars.2021.666160

Mixoplankton interferences in dilution grazing experiments

Auteurs: Guilherme D. Ferreira, Filomena Romano, Nikola Medić, Paraskevi Pitta, Per Juel Hansen, Kevin J. Flynn, Aditee Mitra, Albert Calbet
Publié dans: Scientific Reports, Numéro 11, 2021, ISSN 2045-2322
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-021-03176-0

A Manual For Isolation And Culture Of Mixoplankton To Support Experimental Studies.

Auteurs: Hansen PJ, Flynn KJ, Mitra A, Calbet A, Saiz E, Pitta P, Maselli M, Medić N, Romano F, Traboni C
Publié dans: Zenodo, 2021
Éditeur: Zenodo
DOI: 10.5281/zenodo.5520864

Novel Approaches For Investigating Marine Planktonic Mixotrophy

Auteurs: Aditee, MITRA; J, FLYNN Kevin; Konstantinos, ANESTIS; S, MANSOUR Joost; D, FERREIRA Guilherme; Albert, CALBET
Publié dans: Zenodo, Numéro 9, 2021
Éditeur: Zenodo
DOI: 10.5281/zenodo.5148499

Enhancing Microalgal Production - constructing decision support tools using system dynamics modelling

Auteurs: Flynn, Kevin John
Publié dans: Zenodo, Numéro 9, 2021
Éditeur: Zenodo
DOI: 10.5281/zenodo.5036605

A Simple N-based Mixoplankton Model

Auteurs: Flynn, Kevin John; Mitra, Aditee
Publié dans: Zenodo, Numéro 7, 2021
Éditeur: Zenodo
DOI: 10.5281/zenodo.5040445

A guide for field studies and environmental monitoring of mixoplankton populations

Auteurs: Mitra, Aditee; Gypens, Nathalie; Hansen, Per Juel; Flynn, Kevin J
Publié dans: Zenodo, Numéro 13, 2021
Éditeur: Zenodo
DOI: 10.5281/zenodo.5054916

Seasonal Distribution Of Non-Constitutive Mixoplankton Across Arctic, Temperate And Mediterranean Coastal Waters

Auteurs: Mitra, Aditee; Hansen, Per Juel; Flynn, Kevin J
Publié dans: Zenodo, Numéro 2, 2021
Éditeur: Zenodo
DOI: 10.5281/zenodo.5055708

Mixotrophy of photosymbiotic Radiolaria

Auteurs: Joost Samir Mansour
Publié dans: 2021
Éditeur: HAL

Uncoupling heterotrophic and mixotrophic predation using Rotenone, a mitochondrial inhibitor

Auteurs: Duarte Ferreira, Guilherme; Calbet, Albert
Publié dans: Numéro 2, 2019
Éditeur: Digital CSIC

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