Objectif
Haloalkane dehalogenases (HLDs) catalyse the cleavage of the carbon-halogen bond of industrial organohalogen compounds and are interesting subjects to study molecular evolution. Strikingly, HLDs display remarkable sequence and structural similarity with luciferase from the marine invertebrate Renilla reniformis (RLuc), which reflects their common evolutionary history. Unlike HLDs, which are α/β hydrolases (EC 3.8.1.5) the RLuc luciferase is cofactor-independent monooxygenase (EC 1.13.12.5) that converts coelenterazine into coelenteramide and carbon dioxide, followed by an emission of blue light. Yet, the evolutionary steps driving their functional divergence remain poorly understood. Our proof-of-concept data show the feasibility of the reconstruction of an ancestral enzyme, which existed prior to the functional divergence of the modern-day HLD and RLuc homologues, and that this in-lab resurrected enzyme exhibits so-far unobserved dual dehalogenase/luciferase activity. This project aims to dissect structural and biochemical basis of this unusual biocatalytic behaviour of the ancestral enzyme. Specifically, X-ray crystallography, including time-resolved studies with photo-switchable substrate analogues, and advanced mass spectrometry techniques will be employed to probe enzyme-substrate complexes in order to get molecular insights into the inner organization and workings of the catalytically promiscuous enzyme. Complementary site-directed mutagenesis and molecular dynamics simulations will explore the contributions of individual amino acid residues to the dual-function activity. The gained knowledge will extend our in-depth understanding of the evolution of underlying biocatalytic reaction mechanisms. Furthermore, it will pave the way for the development of novel software tools for the rational engineering of next-generation biocatalysts for specific uses in biotechnology and biomedicine.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences chimiques chimie organique amines
- sciences naturelles sciences chimiques chimie analytique spectrométrie de masse
- sciences naturelles sciences biologiques biologie moléculaire évolution moléculaire
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines enzyme
- sciences naturelles sciences chimiques chimie organique composés organohalogénés
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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H2020-EU.1.3. - EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions
PROGRAMME PRINCIPAL
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H2020-EU.1.3.2. - Nurturing excellence by means of cross-border and cross-sector mobility
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
MSCA-IF-EF-ST - Standard EF
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) H2020-MSCA-IF-2017
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
601 77 Brno
Tchéquie
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.