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CORDIS - Résultats de la recherche de l’UE
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Potato Multi-Allele Scanning Haplotags – a low cost, genome-scanning marker system for use in potato breeding

Objectif

"Potato breeding is a 10-year process that involves combining over 40 characteristics to produce varieties that have improved sustainability, utilisation and consumer characteristics. Genomic and marker assisted selection (GS and MAS) can make breeding faster/more efficient, increasing the rate of genetic gain and the ability to combine multiple traits. Strategies for GS to date have tended to employ many thousands of markers; however, the economic burden of deploying such approaches on thousands of plants annually in a breeding programme may restrict the adoption of GS. The objective of this action is to develop a novel, low cost, genome-scanning marker platform for use in simultaneous GS and MAS for multiple traits in potato breeding, by combining existing knowledge on the patterns of linkage disequilibrium in potato with recent advances in genotyping-by-sequencing approaches based on massively multiplex PCR. The marker system will target clusters of SNPs whose aggregate profile over distances covered by paired-end next generation sequencing (NGS) reads will allow them to be used as haplotags. Unlike bi-allelic SNPs, haplotags can discriminate multiple allelic variants in tetraploid potato. Approximately 400 loci at placed at 1Mb spacing throughout the euchromatic portion of the genome, and a further 100 SNPs linked to specific traits, will be targeted and assayed using an approach called GT-Seq, which uses combinatorial barcoding to allow multiplexing of thousands of samples in a single NGS run. The sequencing platform will be utilised in conjunction with 2 training populations to develop genomic prediction equations for yield and fry colour of potato. Subsequently, it will be deployed for combined GS and MAS on 1000 plants from the second field generation of a commercial potato breeding programme. The research and training activities in the fellowship proposal will equip a young postdoctoral researcher with the skills of a ""next generation plant breeder"".


"

Champ scientifique (EuroSciVoc)

CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.

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Programme(s)

Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.

Thème(s)

Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.

Régime de financement

Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.

MSCA-IF-EF-ST - Standard EF

Voir tous les projets financés dans le cadre de ce programme de financement

Appel à propositions

Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.

(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) H2020-MSCA-IF-2017

Voir tous les projets financés au titre de cet appel

Coordinateur

TEAGASC - AGRICULTURE AND FOOD DEVELOPMENT AUTHORITY
Contribution nette de l'UE

La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.

€ 175 866,00
Coût total

Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.

€ 175 866,00
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