Objectif
High-throughput transcriptomic analyses in human cell lines have found that >80% of the genome is transcriptionally
active. A major part of this massive genomic output is derived from RNA polymerase II (RNAPII) activity; such as, mRNA,
sn(o)RNA and long non-coding RNA. However, although these transcripts all contain 5’-m7G caps, which are common
hallmarks of RNAPII-derived transcripts, their fates differ substantially as some are rapidly degraded while others remain
stable and exercise diverse functions in the cell. What is the underlying mechanism? Transcript fate decisions are ultimately
dictated by the proteins with which the nascent RNA associate. Central to this process is the cap-binding complex (CBC).
Through its early association with the 5’-m7G cap, the CBC directs a plethora of nuclear RNA metabolic events by serving
as a landing pad to recruit productive and/or destructive factors. Therefore, composition of the early RNA-protein particle
plays an essential role in dictating RNA fate, and the CBC and its cofactors pose an interesting dichotomous system to study
as a model for sorting mechanisms dictating RNA fate.
In my project, I will delineate the spatiotemporal recruitment kinetics of selected RNA metabolic factors to identify when RNA
fate decisions are made during transcription and how RNA/DNA elements contribute. To resolve the sequential loading of
the CBC and its cofactors onto elongating transcripts, I will develop time course UV cross-linking and immunoprecipitation
(CLIP) experiments, combining metabolic labelling of RNA, using the photoactivatable ribonucleoside analogue 4-sU, with a
new and unprecedentedly high powered UV cross-linking technology employed at multiple short time increments. This will
for the first time enable the study of in vivo RNA binding kinetics of RNA-binding proteins with a temporal resolution
necessary to characterise co-transcriptional RNA fate decisions.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques génétique ADN
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines
- sciences naturelles sciences biologiques génétique ARN
- sciences naturelles sciences biologiques génétique génome
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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-
H2020-EU.1.3. - EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions
PROGRAMME PRINCIPAL
Voir tous les projets financés dans le cadre de ce programme -
H2020-EU.1.3.2. - Nurturing excellence by means of cross-border and cross-sector mobility
Voir tous les projets financés dans le cadre de ce programme
Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) H2020-MSCA-IF-2017
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
8000 Aarhus C
Danemark
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.