Objectif
Embryonic development requires precise spatio-temporal gene expression generating numerous cell types that build the animal body plan. Cell-fate specification and patterning are driven by developmental genes that are often expressed in complex and conserved fashion. Gene expression is precisely modulated by gene regulatory networks (GRNs) constructed through the integration of signalling pathways acting at cis-regulatory elements (CREs). While signalling pathways and GRNs are evolutionary constrained, CREs are poorly conserved at the sequence level, posing the question which cis-regulatory mechanisms facilitate coordinated and conserved gene expression patterns during animal development and evolution. CREs and their target genes are spatially restricted into conserved 3D chromatin structures suggesting a possible link between the less conserved CREs and highly conserved gene expression patterns.
In this proposal, I aim to identify CREs that differentially respond to signalling cascades. Novel approaches, such as HiChIP and capture Hi-C, will be applied to decipher the chromatin structure of the associated CREs and their target genes. The application of this approach in two distantly related vertebrate model organisms will allow me to gain insight into genome-wide evolutionary conserved nodes of GRNs controlled by these pathways. Furthermore, detailed analysis of chromatin structures induced by activation or inhibition of signaling cascades will further contribute to understanding of co-dependency and complementarity of genome architecture, cis-regulatory information, and signalling pathways. 3Dcis research will shed light on the mechanisms driving conserved gene expression patterns and common body structures, but also the constraints that different animal lineages have faced during their evolutionary path. Finally, the results will make ground breaking advances in our understanding of how cis-regulatory information and structure of our genome translate into function
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques biologie du développement
- sciences naturelles sciences biologiques génétique génome
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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-
H2020-EU.1.3. - EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions
PROGRAMME PRINCIPAL
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H2020-EU.1.3.2. - Nurturing excellence by means of cross-border and cross-sector mobility
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
MSCA-IF-EF-ST - Standard EF
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) H2020-MSCA-IF-2017
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
28006 MADRID
Espagne
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.