Ice Age Genomic Tracking of Refugia and Postglacial Dispersal

Informations projet

IceAGenT

N° de convention de subvention: 819192

DOI

10.3030/819192

Projet clôturé

Date de signature de la CE 20 Mars 2019

Date de début 1 Octobre 2019

Date de fin 30 Septembre 2025

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coût total

€ 2 189 775,75

Contribution de l’UE

€ 2 189 775,75

Coordonné par

UNIVERSITETET I TROMSOE - NORGES ARKTISKE UNIVERSITET
Norway

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Publications

Peer reviewed articles (21)

wholeskim: Utilising Genome Skims for Taxonomically Annotating Ancient <scp>DNA</scp> Metagenomes

Auteurs: Lucas Elliott, Frédéric Boyer, Teo Lemane, null null, Inger Greve Alsos, Eric Coissac
Publié dans: Molecular Ecology Resources, Numéro 25, 2025, ISSN 1755-098X
Éditeur: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/1755-0998.70001

Sedimentary Ancient DNA Reveals Local Vegetation Changes Driven by Glacial Activity and Climate

Auteurs: Lucas D. Elliott; Dilli P. Rijal; Antony G. Brown; Jostein Bakke; Lasse Topstad; Peter D. Heintzman; Inger G. Alsos
Publié dans: Quaternary, Numéro 6, 2023, ISSN 2571-550X
Éditeur: MPDI
DOI: 10.3390/quat6010007

Wild and domesticated animal abundance is associated with greater late-Holocene alpine plant diversity

Auteurs: Sandra Garcés-Pastor, Peter D. Heintzman, Scarlett Zetter, Youri Lammers, Nigel G. Yoccoz, Jean-Paul Theurillat, Christoph Schwörer, Andreas Tribsch, Kevin Walsh, Boris Vannière, Owen S. Wangensteen, Oliver Heiri, Eric Coissac, Sébastien Lavergne, Lieveke van Vugt, Fabian Rey, Charline Giguet-Covex, Gentile Francesco Ficetola, Dirk N. Karger, Loïc Pellissier, Robert Schabetsberger, Jean Nicol
Publié dans: Nature Communications, Numéro 16, 2025, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-025-59028-2

Ancient sedimentary DNA shows rapid post-glacial colonisation of Iceland followed by relatively stable vegetation until the Norse settlement (Landnám) AD 870

Auteurs: Inger Greve Alsos, Youri Lammers, Sofia E. Kjellman, Marie Kristine Føreid Merkel, Emma M. Bender, Alexandra Rouillard, Egill Erlendsson, Esther Ruth Guðmundsdóttir, Ívar Örn Benediktsson, Wesley R. Farnsworth, Skafti Brynjólfsson, Guðrún Gísladóttir, Sigrún Dögg Eddudóttir, Anders Schomacker
Publié dans: Quaternary Science Reviews, Numéro 259, 2021, Page(s) 106903, ISSN 0277-3791
Éditeur: Pergamon Press Ltd.
DOI: 10.1016/j.quascirev.2021.106903

Postglacial species arrival and diversity build-up of northern ecosystems took millennia

Auteurs: INGER GREVE ALSOS, DILLI PRASAD RIJAL, DOROTHEE EHRICH, DIRK NIKOLAUS KARGER, NIGEL GILLES YOCCOZ, PETER D. HEINTZMAN, ANTONY G. BROWN, YOURI LAMMERS, LOÏC PELLISSIER, TORBJØRN ALM, KARI ANNE BRÅTHEN, ERIC COISSAC, MARIE KRISTINE FØREID MERKEL, ADRIANA ALBERTI, FRANCE DENOEUD, JOSTEIN BAKKE, PHYLONORWAY CONSORTIUM
Publié dans: Science Advances, Numéro 28th of September 2022, 2022, ISSN 2375-2548
Éditeur: AAAS
DOI: 10.1126/sciadv.abo7434

A 75,000-y-old Scandinavian Arctic cave deposit reveals past faunal diversity and paleoenvironment

Auteurs: Samuel J. Walker, Aurélie Boilard, Mona Henriksen, Edana Lord, Marius Robu, Jan-Pieter Buylaert, Liselotte M. Takken Beijersbergen, Lene Synnøve Halvorsen, Adriana M. Cintrón-Santiago, Emma Katrin Onshuus, Christopher Alan Cockerill, Gabor Ujvari, László Palcsu, Marjan Temovski, Jenny Maccali, Henriette Linge, Jesper Olsen, Sverre Aksnes, Anastasia Bertheussen, Ola Lygre, Inger G. Alsos, Love
Publié dans: Proceedings of the National Academy of Sciences, Numéro 122, 2025, ISSN 0027-8424
Éditeur: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.2415008122

SedaDNA shows that transhumance of domestic herbivores has enhanced plant diversity over the Holocene in the Eastern European Alps

Auteurs: Scarlett Zetter, Sandra Garcés-Pastor, Youri Lammers, Antony G Brown, Kevin Walsh, Tomasz Goslar, Sébastien Lavergne, Eric Coissac, PhyloAlps Consortium, Andreas Tribsch, Peter D Heintzman, Inger Greve Alsos
Publié dans: The Holocene, Numéro 35, 2025, Page(s) 383-396, ISSN 0959-6836
Éditeur: SAGE Publications
DOI: 10.1177/09596836241307304

Lateglacial and Early Holocene palaeoenvironmental change and human activity at Killerby Quarry, North Yorkshire, UK

Auteurs: Samuel M Hudson; Clive Waddington; Ben Pears; Natalie Ellis; Luke Parker; Derek Hamilton; Inger Greve Alsos; Paul Hughes; Antony Brown
Publié dans: Journal of Quaternary Science, Numéro 38, 2023, ISSN 1099-1417
Éditeur: Wiley
DOI: 10.1002/jqs.3488

Using ancient sedimentary DNA to forecast ecosystem trajectories under climate change

Auteurs: Inger Greve Alsos, Victor Boussange, Dilli Prasad Rijal, Marieke Beaulieu, Antony Gavin Brown, Ulrike Herzschuh, Jens-Christian Svenning and Loïc Pellissier
Publié dans: Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences, Numéro 379, 2024, ISSN 1471-2970
Éditeur: The Royal Society
DOI: 10.1098/rstb.2023.0017

Uncovering Holocene climate fluctuations and ancient conifer populations: Insights from a high-resolution multi-proxy record from Northern Finland

Auteurs: J. Sakari Salonen, Niina Kuosmanen, Inger G. Alsos, Peter D. Heintzman, Dilli P. Rijal, Frederik Schenk, Freja Bogren, Miska Luoto, Annemarie Philip, Sanna Piilo, Liva Trasune, Minna Väliranta, Karin F. Helmens
Publié dans: Global and Planetary Change, 2024, ISSN 0921-8181
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.gloplacha.2024.104462

Last Glacial Maximum environmental conditions at Andøya, northern Norway; evidence for a northern ice-edge ecological “hotspot”

Auteurs: Inger G. Alsos, Per Sjögren, Antony G. Brown, Ludovic Gielly, Marie Kristine Føreid Merkel, Aage Paus, Youri Lammers, Mary E. Edwards, Torbjørn Alm, Melanie Leng, Tomasz Goslar, Catherine T. Langdon, Jostein Bakke, Willem G.M. van der Bilt
Publié dans: Quaternary Science Reviews, Numéro 239, 2020, Page(s) 106364, ISSN 0277-3791
Éditeur: Pergamon Press Ltd.
DOI: 10.1016/j.quascirev.2020.106364

Multiplexing <scp>PCR</scp> allows the identification of within‐species genetic diversity in ancient <scp>eDNA</scp>

Auteurs: Y. Lammers; P. Taberlet; E. Coissac; L. D. Elliott; M. F. Merkel; I. Pitelkova; I. G. Alsos
Publié dans: Molecular Ecology Resources, Numéro 24, 2024, ISSN 1755-0998
Éditeur: John Wiley and Sons
DOI: 10.1111/1755-0998.13926

Phylogeography of Arctic plants: where are we after 35 years, and where to go?

Auteurs: Christian Brochmann, Cassandra Elphinstone, Siri Birkeland, Hajime Ikeda, Pernille B. Eidesen, Inger G. Alsos, Kristine B. Westergaard
Publié dans: Plant Ecology &amp; Diversity, 2025, Page(s) 1-25, ISSN 1755-0874
Éditeur: Taylor & Francis
DOI: 10.1080/17550874.2025.2571098

The progressive evolution of cold-adapted species

Auteurs: John R. Stewart, Inger G. Alsos, Antony G. Brown, Love Dalén, Peter D. Heintzman
Publié dans: Trends in Ecology &amp; Evolution, Numéro 40, 2025, Page(s) 687-698, ISSN 0169-5347
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.tree.2025.04.005

Late Quaternary dynamics of Arctic biota from ancient environmental genomics

Auteurs: Yucheng Wang, Mikkel Winter Pedersen, Inger Greve Alsos,,, Eric Coissac,,, Youri Lammers, ,, et al.
Publié dans: Nature, Numéro 600, 2021, Page(s) 86-92, ISSN 1476-4687
Éditeur: Springer Nature
DOI: 10.1038/s41586-021-04016-x

Can Amplicon Sequencing Be Replaced by Metagenomics for Biodiversity Inventories?

Auteurs: Lucas Elliott, Eric Coissac
Publié dans: Molecular Ecology Resources, Numéro 25, 2025, ISSN 1755-098X
Éditeur: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/1755-0998.70047

Neolithic pastoralism and plant community interactions at high altitudes of the Pyrenees, southern Europe

Auteurs: Irene Julián-Posada, Graciela Gil-Romera, Sandra Garcés-Pastor, Peter D. Heintzman, Daniel Gómez, Federico Fillat, Ana Moreno, Javier Lara-Recuero, Pere Bover, Lourdes Montes, Alejandro Sierra, Blas Valero-Garcés, Inger G. Alsos, Penélope González-Sampériz
Publié dans: Communications Earth &amp; Environment, Numéro 6, 2025, ISSN 2662-4435
Éditeur: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/s43247-025-02023-8

A 2-million-year-old ecosystem in Greenland uncovered by environmental DNA

Auteurs: Kurt H. Kjær; Mikkel Winther Pedersen; Bianca De Sanctis; Binia De Cahsan; Thorfinn S. Korneliussen; Christian S. Michelsen; Karina K. Sand; Stanislav Jelavić; Anthony H. Ruter; Astrid M. A. Schmidt; Kristian K. Kjeldsen; Alexey S. Tesakov; Ian Snowball; John C. Gosse; Inger G. Alsos; Yucheng Wang; Christoph Dockter; Magnus Rasmussen; Morten E. Jørgensen; Birgitte Skadhauge; Ana Prohaska; Jeppe
Publié dans: Nature, Numéro 612, 2022, Page(s) 283-291, ISSN 0028-0836
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-022-05453-y

Human transformation of past terrestrial ecosystems

Auteurs: Sandra Nogué, Naia Morueta-Holme, José María Fernández-Palacios, Inger G. Alsos, Anthony Brown, Patrick Roberts, Josep Peñuelas
Publié dans: Nature Reviews Biodiversity, Numéro 1, 2025, Page(s) 644-656, ISSN 3005-0677
Éditeur: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/s44358-025-00081-6

Millennia of metacommunity diversification and homogenization captured by sedimentary ancient DNA

Auteurs: Dilli Prasad Rijal, Antony Brown, Nigel Yoccoz, Peter Heintzman, Inger Alsos, Kari Anne Bråthen
Publié dans: Ecology Letters, Numéro 28, 2025, Page(s) e70218, ISSN 1461-0248
Éditeur: Wiley
DOI: 10.22541/au.174895925.54844679/v1

Potential plant extinctions with the loss of the Pleistocene mammoth steppe

Auteurs: Jérémy Courtin, Kathleen R. Stoof-Leichsenring, Simeon Lisovski, Ying Liu, Inger Greve Alsos, Boris K. Biskaborn, Bernhard Diekmann, Martin Melles, Bernd Wagner, Luidmila Pestryakova, James Russell, Yongsong Huang, Ulrike Herzschuh
Publié dans: Nature Communications, Numéro 16, 2025, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-024-55542-x

Book chapters (2)

The Sedimentary Ancient DNA Workflow

Auteurs: Peter D. Heintzman, Kevin Nota, Alexandra Rouillard, Youri Lammers, Tyler J. Murchie, Linda Armbrecht, Sandra Garcés-Pastor, Benjamin Vernot
Publié dans: Developments in Paleoenvironmental Research, Tracking Environmental Change Using Lake Sediments, 2024, Page(s) 53-84
Éditeur: Springer International Publishing
DOI: 10.1007/978-3-031-43799-1_3

Terrestrial Plant DNA from Lake Sediments

Auteurs: Sandra Garcés-Pastor, Kevin Nota, Dilli P. Rijal, Sisi Liu, Weihan Jia, Maria Leunda, Christoph Schwören, Sarah E. Crump, Laura Parducci, Inger Greve Alsos
Publié dans: Tracking Environmental Change Using Lake Sediments, Numéro Development in Paleoenvironmetal Reserach 21, 2024, Page(s) 275-298, ISSN 1571-5299
Éditeur: Springer
DOI: 10.1007/978-3-031-43799-1

Thesis and dissertations (2)

Echoes of the Past: Finding the Secrets of Ancient Ecosystems using SedaDNA

Auteurs: Scarlette Zetter
Publié dans: Echoes of the Past: Finding the Secrets of Ancient Ecosystems using SedaDNA, 2025, ISBN 978-82-8266-283-3
Éditeur: UiT - The Arctic University of Norway

Unlocking the potential of sedimentary ancient DNA

Auteurs: Lucas Dane Elliott
Publié dans: Unlocking the potential of sedimentary ancient DNA, 2024, ISBN 978-82-8266-268-0
Éditeur: UiT - The Arctic University of Norway