Testing new hypotheses on the evolution of sex-related chromosomes

Informations projet

EvolSexChrom

N° de convention de subvention: 832352

DOI

10.3030/832352

Projet clôturé

Date de signature de la CE 4 Juin 2019

Date de début 1 Octobre 2019

Date de fin 30 Septembre 2025

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coût total

€ 2 500 000,00

Contribution de l’UE

€ 2 500 000,00

Coordonné par

CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE CNRS
France

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Publications

Peer reviewed articles (20)

Why do sex chromosomes progressively lose recombination?

Auteurs: Paul Jay Daniel Jeffries Fanny E. Hartmann Amandine Véber Tatiana Giraud
Publié dans: Trends in Genetics, 2024, ISSN 0168-9525
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.tig.2024.03.005

Onset and stepwise extensions of recombination suppression are common in mating-type chromosomes of Microbotryum anther-smut fungi

Auteurs: Marine Duhamel, Fantin Carpentier, Dominik Begerow, Michael E. Hood, Ricardo C. Rodríguez de la Vega, Tatiana Giraud
Publié dans: Journal of Evolutionary Biology, 2022, ISSN 1420-9101
Éditeur: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/jeb.13991

Sheltered load in fungal mating-type chromosomes revealed by fitness experiments

Auteurs: Lou Guyot, Elizabeth Chahine, Elsa De Filippo, Christophe Lalanne, Sylvain Brun, Fanny Hartmann, Tatiana Giraud
Publié dans: Journal of Evolutionary Biology, 2025, ISSN 1420-9101
Éditeur: Oxford University Press (OUP)
DOI: 10.1093/jeb/voaf079

Size variation of the non-recombining region on the mating-type chromosomes in the fungal Podospora anserina species complex

Auteurs: Fanny E Hartmann, S Lorena Ament-Velásquez, Aaron A Vogan, Valérie Gautier, Stephanie Le Prieur, Myriam Berramdane, Alodie Snirc, Hanna Johannesson, Pierre Grognet, Fabienne Malagnac, Philippe Silar, Tatiana Giraud
Publié dans: Molecular Biology and Evolution, 2021, ISSN 0737-4038
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/molbev/msab040

High-Quality Genome Assemblies of 4 Members of thePodospora anserina Species Complex

Auteurs: S. Lorena Ament-Velásquez 1,*, Aaron A. Vogan 2, Ola Wallerman3, Fanny E. Hartmann 4, Valérie Gautier5, Philippe Silar 5, Tatiana Giraud4, and Hanna Johannesson
Publié dans: Genome Biology and Evolution, 2024, ISSN 1759-6653
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/gbe/evae034

Stepwise recombination suppression around the mating-type locus in an ascomycete fungus with self-fertile spores

Auteurs: Nina Vittorelli; Ricardo C. Rodríguez de la Vega; Alodie Snirc; Emilie Levert; Valérie Gautier; Christophe Lalanne; Elsa De Filippo; Pierre Gladieux; Sonia Guillou; Yu Zhang; Sravanthi Tejomurthula; Igor V. Grigoriev; Robert Debuchy; Philippe Silar; Tatiana Giraud; Fanny E. Hartmann
Publié dans: Plos Genetics, Numéro 1, 2023, Page(s) e1010347, ISSN 1553-7390
Éditeur: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.pgen.1010347

Identification of the First Oomycete Mating-type Locus Sequence in the Grapevine Downy Mildew Pathogen, Plasmopara viticola

Auteurs: Yann Dussert, Ludovic Legrand, Isabelle D. Mazet, Carole Couture, Marie-Christine Piron, Rémy-Félix Serre, Olivier Bouchez, Pere Mestre, Silvia Laura Toffolatti, Tatiana Giraud, François Delmotte
Publié dans: Current Biology, Numéro 30/20, 2020, Page(s) 3897-3907.e4, ISSN 0960-9822
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cub.2020.07.057

Dynamics of transposable element accumulation in the non-recombining regions of mating-type chromosomes in anther-smut fungi

Auteurs: Duhamel Marine, Hood Michael E., Rodríguez de la Vega Ricardo C., Giraud Tatiana
Publié dans: Nature Communications, 2023, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-41413-4

Important role of melanin for fertility in the fungus Podospora anserina

Auteurs: Valerie Gautier, Emilie Levert, Tatiana Giraud, Philippe Silar
Publié dans: G3 Genes|Genomes|Genetics, 2021, ISSN 2160-1836
Éditeur: Genetics Society of America
DOI: 10.1093/g3journal/jkab159

Repeated loss of function at HD mating-type genes and of recombination in anther-smut fungi

Auteurs: Elise A. Lucotte, Paul Jay, Quentin Rougemont, Loreleï Boyer, Amandine Cornille, Alodie Snirc, Amandine Labat, Elizabeth Chahine, Marine Duhamel, Alice Namias, Jacob Gendelman, Wen-Juan Ma, Roxanne K. Hayes, Shikhi Baruri, Joseph P. Ham, Michael H. Perlin, Michael E. Hood, Ricardo C. Rodríguez de la Vega, Tatiana Giraud
Publié dans: Nature Communications, Numéro 16, 2025, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-025-60222-5

Higher gene flow in sex-related chromosomes than in autosomes during fungal divergence

Auteurs: Fanny E Hartmann, Ricardo C Rodríguez de la Vega, Pierre Gladieux, Wen-Juan Ma, Michael E Hood, Tatiana Giraud
Publié dans: Molecular Biology and Evolution, 2019, ISSN 0737-4038
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/molbev/msz252

An Inversion Polymorphism Under Balancing Selection, Involving Giant Mobile Elements, in an Invasive Fungal Pathogen

Auteurs: Fanny E Hartmann, Ricardo C Rodríguez de la Vega, Arthur Demené, Thomas Badet, Jean-Philippe Vernadet, Quentin Rougemont, Amandine Labat, Alodie Snirc, Lea Stauber, Daniel Croll, Simone Prospero, Cyril Dutech, Tatiana Giraud
Publié dans: Molecular Biology and Evolution, Numéro 42, 2025, ISSN 0737-4038
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/molbev/msaf026

The <i>Silene latifolia</i> genome and its giant Y chromosome

Auteurs: Carol Moraga, Catarina Branco, Quentin Rougemont, Pavel Jedlička, Eddy Mendoza-Galindo, Paris Veltsos, Melissa Hanique, Ricardo C. Rodríguez de la Vega, Eric Tannier, Xiaodong Liu, Claire Lemaitre, Peter D. Fields, Corinne Cruaud, Karine Labadie, Caroline Belser, Jerome Briolay, Sylvain Santoni, Radim Cegan, Raquel Linheiro, Gabriele Adam, Adil El Filali, Vinciane Mossion, Adnane Boualem, Raquel
Publié dans: Science, Numéro 387, 2025, Page(s) 630-636, ISSN 0036-8075
Éditeur: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/science.adj7430

Mating-Type Locus Organization and Mating-Type Chromosome Differentiation in the Bipolar Edible Button Mushroom Agaricus bisporus

Auteurs: Marie Foulongne-Oriol; Ozgur Taskent; Ursula Kües; Anton S.M. Sonnenberg; Arend F. van Peer; Tatiana Giraud
Publié dans: Genes, Numéro 1, 2021, ISSN 2073-4425
Éditeur: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/genes12071079

Tempo of degeneration across independently evolved non-recombining regions

Auteurs: Fantin Carpentier, Ricardo C. Rodriguez de la Vega, Paul Jay, Marine Duhamel, Jacqui A. Shykoff, Michael H. Perlin, R. Margaret Wallen, Michael E. Hood, Tatiana Giraud
Publié dans: Molecular Biology and Evolution, 2022, ISSN 1537-1719
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/molbev/msac060

Recombination suppression and evolutionary strata around mating‐type loci in fungi: documenting patterns and understanding evolutionary and mechanistic causes

Auteurs: Fanny E. Hartmann, Marine Duhamel, Fantin Carpentier, Michael E. Hood, Marie Foulongne‐Oriol, Philippe Silar, Fabienne Malagnac, Pierre Grognet, Tatiana Giraud
Publié dans: New Phytologist, Numéro 229/5, 2021, Page(s) 2470-2491, ISSN 0028-646X
Éditeur: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/nph.17039

EASYstrata: an all-in-one workflow for genome annotation and genomic divergence analysis

Auteurs: Quentin Rougemont, Elise Lucotte, Loreleï Boyer, Alexandra Jalaber de Dinechin, Alodie Snirc, Tatiana Giraud, Ricardo C Rodríguez de la Vega
Publié dans: NAR Genomics and Bioinformatics, Numéro 7, 2025, ISSN 2631-9268
Éditeur: Oxford University Press (OUP)
DOI: 10.1093/nargab/lqaf110

The fate of recessive deleterious or overdominant mutations near mating-type loci under partial selfing

Auteurs: Tezenas, Emilie; Giraud, Tatiana; Véber, Amandine; Billiard, Sylvain
Publié dans: Peer Community Journal, 2023, ISSN 2804-3871
Éditeur: Peer Community
DOI: 10.24072/pcjournal.238

Differential Gene Expression between Fungal Mating Types Is Associated with Sequence Degeneration

Auteurs: Wen-Juan Ma, Fantin Carpentier, Tatiana Giraud, Michael E Hood
Publié dans: Genome Biology and Evolution, Numéro 12/4, 2020, Page(s) 243-258, ISSN 1759-6653
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/gbe/evaa028

Genetic differentiation in the <i>MAT</i>-proximal region is not sufficient for suppressing recombination in <i>Podospora anserina</i>

Auteurs: Pierre Grognet, Robert Debuchy, Tatiana Giraud
Publié dans: G3: Genes, Genomes, Genetics, Numéro 15, 2025, ISSN 2160-1836
Éditeur: Genetics Society of America
DOI: 10.1093/g3journal/jkaf015