Description du projet
Les mécanismes de transcription chez les plantes sous les feux de la rampe
Les végétaux ont développé des mécanismes sophistiqués pour répondre aux changements environnementaux grâce à des voies de signalisation interconnectées. Chez les plantes, les informations sur la régulation transcriptionnelle en réponse à différents stimuli reposent essentiellement sur l’identification des voies de signalisation et des agents de transcription dans une réponse particulière. Le projet TRANSLIGHT, financé par l’UE, utilisera deux méthodes complémentaires fondées sur la spectrométrie de masse quantitative pour isoler les complexes protéiques dans les cellules végétales à différentes phases du cycle de transcription et en réponse à la lumière. Il combinera ces méthodes afin d’identifier les mécanismes de transcription spécifiques à une région chez les plantes et d’étudier la composition dynamique de ces complexes en réponse à la lumière.
Objectif
Due to their sessile nature, plants have evolved very sophisticated mechanisms to respond and adjust to the changes in environmental conditions. They do so through interconnected signaling pathways that trigger global changes in gene expression. Information about transcriptional regulation in response to different stimuli in plants relies mostly on the identification of the signaling pathways and transcription factors involved in a particular response. Importantly, investigations in yeast and humans indicate that the activity of the RNA Polymerase II (RNAPII) complex itself is subjected to a tight regulation by multiple interacting factors that respond to endogenous and exogenous stimuli. Therefore, environment-dependent changes in the activity of this transcriptional machinery seem a plausible new layer of regulation to fine-tune the transcriptional response to external stimuli in plants. In this proposal, we aim to use two complementary approaches based on quantitative mass spectrometry to isolate protein complexes in plant cells at different phases of the transcription cycle and, more important, in response to a major environmental stimulus, light. The first approach relies on the use of deactivated CRISPR/Cas9 to target proximal promoter regions and isolate proteins complexes involved in early events of light-induced transcription. In the second approach, we will identify RNAPII-associated complexes specific of transcription initiation and late elongation/termination. It relies on the use of antibodies that recognize Ser5P and Ser2P marks in the RNAPII, hallmarks of transcription initiation and termination, respectively, to isolate the region-specific RNAPII-associated complexes. Together, these two approaches will allow us i) to identify region-specific transcription machinery components in plants, both conserved and likely plant-specific ii) to study the dynamic composition of these complexes during the response to light.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
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Mots‑clés
Programme(s)
Appel à propositions
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) H2020-MSCA-IF-2018
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MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)Coordinateur
28006 Madrid
Espagne