Description du projet
Le rôle des protéines de transfert dans la compartimentation et le métabolisme des lipides
Les membranes cellulaires des cellules eucaryotes présentent des compositions lipidiques différentes, ce qui permet de séparer divers processus biologiques et d’enrichir spécifiquement des protéines de signalisation, enzymatiques et structurelles. Cet enrichissement différentiel en lipides résulte de la synthèse, de la dégradation et du transport de ces derniers entre les membranes par ce que l’on nomme les LTP (protéines de transfert de lipides) qui facilitent le passage des lipides non vésiculaires à travers les espaces aqueux. Mais le mode d’action de la majorité des LTP, des cargos de lipides et des organites ciblés reste inconnu. L’objectif du projet LipTransProMet, financé par l’UE, est d’élucider le rôle des LTP dans le métabolisme des lipides, en utilisant des lignées cellulaires LTP knock-down en combinaison avec des approches de biologie systémique, la lipidomique et le profilage thermique des protéomes.
Objectif
Cellular membranes of eukaryotic cells vary in their lipid composition, which allows segregation of diverse biological processes and specific enrichment of signaling, enzymatic and structural proteins. Differential enrichment of lipids in different membranes stems from compartmentalized synthesis and degradation of lipids, but also from lipid transport between membranes. Lipid transfer proteins (LTPs) facilitate non-vesicular lipid transport through aqueous spaces, and their dysfunction can lead to diseases. They are crucial for many molecular processes because a large part of the proteome depends on membranes for its function. However, for the majority of the more than 100 LTPs in humans, the lipid cargoes, the integration into metabolism, the mode of action, and the targeted organelles remain unknown. The Gavin group recently performed large screens to identify the lipids bound and transported by LTPs, and during my first months in the host lab, I have been involved in the data analysis of these screens.
Our primary objective in the current project is to take the next step by exploring the role of LTPs in lipid metabolism. We will evaluate the effect of LTP knockdown in cell lines with a unique combination of two complementary systems biology approaches: lipidomics and thermal proteome profiling. The integration of these data with previous data from the Gavin group and public databases will highlight lipid metabolic pathways that rely on LTPs for their correct function, and might decipher less obvious connections with other cellular pathways. Moreover, as additional results of this analysis, these data will likely also highlight relevant organelles and maybe even signaling pathways, even further establishing the functions of the LTPs. This project will enhance our insight in the role of non-vesicular transport in lipid metabolism, while the new approach is likely broadly applicable, even for the future study of primary cells from patients.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles informatique et science de l'information science des données
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines protéomique
- sciences naturelles informatique et science de l'information bases de données
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule lipides
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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H2020-EU.1.3. - EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions
PROGRAMME PRINCIPAL
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H2020-EU.1.3.2. - Nurturing excellence by means of cross-border and cross-sector mobility
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
MSCA-IF-EF-ST - Standard EF
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) H2020-MSCA-IF-2018
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
69117 Heidelberg
Allemagne
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.