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Synthetic Oligonucleotide Quality Control Software

Description du projet

Un nouvel outil de contrôle qualité va permettre de garantir que les blocs de construction d’ADN synthétique sont à la hauteur

Le séquençage complet du génome humain a 16 ans et les méthodes de synthèse de l’ADN et de manipulation de l’expression génétique ont considérablement progressé, faisant évoluer les sciences médicales, la biologie, les biotechnologies, l’agriculture et les biens de consommation. L’absence de procédures de contrôle qualité rigoureuses pour l’évaluation de l’ADN synthétique et de ses succédanés constitue une lacune flagrante dans ce domaine. SOLQC prévoit de la combler en optimisant un outil logiciel déjà testé dans plusieurs autres projets. En plus d’améliorer cette technologie, l’équipe élabore un plan d’affaires durable pour porter l’outil sur le marché.

Objectif

DNA synthesis technology has greatly developed over recent years, serving a growing multi-billion synthetic DNA market. Synthetic DNA is used in projects that optimize reagents, chemicals, crops and other organisms, in projects seeking to increase the manufacturing efficiency for the above, as well as in studies of molecular regulation and other cellular processes. The latter is the focus of the MRG-GRammar H2020 FET project.
As the market and application range for synthetic DNA expand a need arises to test and quality control raw synthetic nucleic acids as well as products built upon such reagents. We have developed a prototype software tool for assessing quality parameters in synthetic DNA libraries and used it in several projects in the framework of MRG-GRammar
We propose to productize this prototype into a stable version that will be availed to a broader synthetic biology community. Our proposed product, SOLQC, is a software system that enables management, control and feedback in projects based on synthetic DNA and its applications.
Requested funding will be used to improve usability and user interface, to expand the implementation of analysis and statistical tools, to produce a stable version available to the scientific community and to commercial entities and, finally, to investigate potential sustainable mechanisms for supporting continued service, including commercial or service models

Champ scientifique (EuroSciVoc)

CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc.

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Coordinateur

TECHNION - ISRAEL INSTITUTE OF TECHNOLOGY
Contribution nette de l'UE
€ 43 750,00

Participants (1)