Descripción del proyecto
Genómica de la población antigua para reconstruir las circunstancias evolutivas generales
¿Cómo se diferenciaron los procesos evolutivos entre regiones durante la transición agrícola? ¿Qué adaptaciones genómicas se relacionaron con la transición agrícola de hace unos 10 000 años? ¿Actuó la adaptación de cazador-recolector y los estilos de vida agrícolas en una arquitectura genética similar con patrones diferentes? ¿Hasta qué punto la adaptación en los perros domésticos (la única especie domesticada antes de la transición agrícola) se produjo en convergencia con los humanos? El proyecto AGRICON, financiado con fondos europeos, responderá a estas cuestiones. Estudiará la genómica de la población antigua para reconstruir las circunstancias evolutivas generales que caracterizan a las poblaciones humanas que viven en diferentes continentes. El proyecto desarrollará nuevos métodos computacionales para identificar aditivos adaptativos, analizar la variación en el número de copias, probar los modelos continuos de población y evaluar estadísticamente la convergencia en la arquitectura genómica de la adaptación.
Objetivo
As global climates warmed ca. 10,000 years ago came a remarkable convergent transformation of human lifestyles that occurred independently in multiple continents and human populations. This transition from hunter-gatherer subsistence to food-production catalysed large-scale population growth, offering the opportunity for increased rates of adaptation, but also rapidly presented a large number of independent human populations with a new evolutionary challenge. This project will use ancient population genomics—the only way to directly reconstruct human genetic evolution—to study whether evolutionary processes during the agricultural transition differed in differed regions. Which genomic adaptations were associated with the agricultural transition? Did adaptation to hunter-gatherer and agricultural lifestyles act on similar genetic architecture in different instances? To which extent did adaptation in domestic dogs—the only species domesticated prior to the agricultural transition—occur in convergence with humans? To answer these questions, the project will generate ancient genomic data from pre-agricultural and early agricultural populations from multiple human- and domestic dog populations from Africa, Central America, and Southeast Asia. This will be achieved with direct sequencing as well as a new human ~850,000 SNP capture panel designed to avoid bias towards Eurasian ancestry. We will also develop new computational methods robust to the challenges posed by ancient genomes to identify adaptive admixture, analyse copy number variation, test continuous population models, and statistically assess convergence in the genomic architecture of adaptation. Leveraging cutting-edge ancient genomics and two model organisms for the genomic basis of phenotypic variation, this project aims to reconstruct the universal evolutionary phenomena underpinning a watershed evolutionary episode that shapes global biodiversity and the human condition to this day.
Ámbito científico
Palabras clave
Programa(s)
Régimen de financiación
ERC-STG - Starting GrantInstitución de acogida
NW1 1AT London
Reino Unido