The evolution and regulation of major transitions in sexual systems: new insights from the brown algae

Informations projet

TETHYS

N° de convention de subvention: 864038

DOI

10.3030/864038

Projet clôturé

Date de signature de la CE 20 Decembre 2019

Date de début 1 Janvier 2021

Date de fin 31 Decembre 2025

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coût total

€ 1 999 420,00

Contribution de l’UE

€ 1 999 420,00

Coordonné par

MAX-PLANCK-GESELLSCHAFT ZUR FORDERUNG DER WISSENSCHAFTEN EV
Germany

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Publications

Peer reviewed articles (21)

3D chromatin maps of a brown alga reveal U/V sex chromosome spatial organization

Auteurs: Pengfei Liu, Jeromine Vigneau, Rory J. Craig, Josué Barrera-Redondo, Elena Avdievich, Claudia Martinho, Michael Borg, Fabian B. Haas, Chang Liu, Susana M. Coelho
Publié dans: Nature Communications, Numéro 15, 2024, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-024-53453-5

A partially sex-reversed giant kelp sheds light into the mechanisms of sexual differentiation in a UV sexual system.

Auteurs: D. Mueller; E. Gachet; Olivier Godfroy; J. Gueno; G. Cossard; Maritta Kunert; Akira F. Peters; Renato Westermeier; Wilhelm Boland; J. M. Cock; Agnieszka P. Lipinska; Agnieszka P. Lipinska; Susana M. Coelho; Susana M. Coelho
Publié dans: New Phytologist, Numéro 2, 2021, ISSN 0028-646X
Éditeur: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/nph.17582

Chromatin landscape associated with sexual differentiation in a UV sex determination system

Auteurs: Josselin Gueno; Michael Borg; Simon Bourdareau; Guillaume Cossard; Olivier Godfroy; Agnieszka Lipinska; Leila Tirichine; J Mark Cock; Susana M Coelho
Publié dans: Nucleic Acids Research, Numéro 2, 2022, ISSN 0305-1048
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkac145

The <i>baseless</i> mutant links protein phosphatase 2A with basal cell identity in the brown alga <i>Ectocarpus</i>

Auteurs: Olivier Godfroy, Min Zheng, Haiqin Yao, Agnes Henschen, Akira F. Peters, Delphine Scornet, Sebastien Colin, Paolo Ronchi, Katharina Hipp, Chikako Nagasato, Taizo Motomura, J. Mark Cock, Susana M. Coelho
Publié dans: Development, 2026, ISSN 2692-8205
Éditeur: development
DOI: 10.1101/2022.09.10.507423

A transcriptomic hourglass in brown algae

Auteurs: Jaruwatana Sodai Lotharukpong, Min Zheng, Rémy Luthringer, Daniel Liesner, Hajk-Georg Drost, Susana M. Coelho
Publié dans: Nature, Numéro 635, 2024, Page(s) 129-135, ISSN 0028-0836
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-024-08059-8

A highly contiguous genome assembly reveals sources of genomic novelty in the symbiotic fungus <i>Rhizophagus irregularis</i>

Auteurs: Bethan F Manley, Jaruwatana S Lotharukpong, Josué Barrera-Redondo, Theo Llewellyn, Gokalp Yildirir, Jana Sperschneider, Nicolas Corradi, Uta Paszkowski, Eric A Miska, Alexandra Dallaire
Publié dans: G3: Genes, Genomes, Genetics, Numéro 13, 2024, ISSN 2160-1836
Éditeur: Genetics Society of America
DOI: 10.1093/g3journal/jkad077

Switching it up: algal insights into sexual transitions

Auteurs: Susana M. Coelho, James Umen
Publié dans: Plant Reproduction, Numéro 34, 2021, Page(s) 287-296, ISSN 2194-7953
Éditeur: Springer Verlag
DOI: 10.1007/s00497-021-00417-0

Genome-wide patterns of selection–drift variation strongly associate with organismal traits across the green plant lineage

Auteurs: Kavitha Uthanumallian, Andrea Del Cortona, Susana M. Coelho, Olivier De Clerck, Sebastian Duchene, Heroen Verbruggen
Publié dans: Genome Research, Numéro 34, 2024, Page(s) 1130-1139, ISSN 1088-9051
Éditeur: Cold Spring Harbor Laboratory Press
DOI: 10.1101/gr.279002.124

Characterization of the transposable element landscape shaping the Ectocarpus genome

Auteurs: Erica Dinatale, Rory J. Craig, Claudia Martinho, Hajk-Georg Drost, Susana M. Coelho
Publié dans: Genome Biology, Numéro 26, 2025, ISSN 1474-760X
Éditeur: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1186/s13059-025-03742-z

Efficient CRISPR–Cas genome editing in brown algae

Auteurs: Cláudia Martinho, Masakazu Hoshino, Morgane Raphalen, Viktoriia Bukhanets, Anagha Kerur, Kenny Bogaert, Rémy Luthringer, Susana Coelho
Publié dans: Cell Report Methods, 2026, ISSN 2667-2375
Éditeur: cell press
DOI: 10.1101/2025.07.21.665871

Interactions between U and V sex chromosomes during the life cycle of <i>Ectocarpus</i>

Auteurs: Jeromine Vigneau, Claudia Martinho, Olivier Godfroy, Min Zheng, Fabian B. Haas, Michael Borg, Susana M. Coelho
Publié dans: Development, Numéro 151, 2024, ISSN 0950-1991
Éditeur: The Company of Biologists Ltd.
DOI: 10.1242/dev.202677

Selection drives the evolution of convergent gene expression changes during transitions to co-sexuality in haploid sexual systems

Auteurs: Guillaume G. Cossard, Olivier Godfroy, Zofia Nehr, Corinne Cruaud, J. Mark Cock, Agnieszka Lipinska, Susana M. Coelho
Publié dans: Nature Ecology and Evolution, 2026, ISSN 1537-1719
Éditeur: springer
DOI: 10.1101/2021.07.05.451104

Red macroalgae in the genomic era

Auteurs: Michael Borg, Stacy A. Krueger‐Hadfield, Christophe Destombe, Jonas Collén, Agnieszka Lipinska, Susana M. Coelho
Publié dans: New Phytologist, Numéro 240, 2024, Page(s) 471-488, ISSN 0028-646X
Éditeur: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/nph.19211

Parallel loss of sexual reproduction in field populations of a brown alga sheds light on the mechanisms underlying the emergence of asexuality

Auteurs: Masakazu Hoshino, Guillaume Cossard, Fabian B. Haas, Emma I. Kane, Kazuhiro Kogame, Takahiro Jomori, Toshiyuki Wakimoto, Sylvain Glemin, Susana M. Coelho
Publié dans: Nature Ecology &amp; Evolution, Numéro 8, 2024, Page(s) 1916-1932, ISSN 2397-334X
Éditeur: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/s41559-024-02490-w

Selection drives convergent gene expression changes during transitions to co-sexuality in haploid sexual systems

Auteurs: Guillaume G Cossard, Olivier Godfroy, Zofia Nehr, Corinne Cruaud, J Mark Cock, Agnieszka P Lipinska, Susana M Coelho
Publié dans: Nature Ecology and Evolution, 2022, ISSN 0028-0836
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41559-022-01692-4

Origin and evolutionary trajectories of brown algal sex chromosomes

Auteurs: Josué Barrera-Redondo, Agnieszka P. Lipinska, Pengfei Liu, Erica Dinatale, Guillaume Cossard, Kenny Bogaert, Masakazu Hoshino, Rory J. Craig, Komlan Avia, Goncalo Leiria, Elena Avdievich, Daniel Liesner, Rémy Luthringer, Olivier Godfroy, Svenja Heesch, Zofia Nehr, Loraine Brillet-Guéguen, Akira F. Peters, Galice Hoarau, Gareth Pearson, Jean-Marc Aury, Patrick Wincker, France Denoeud, J Mark Coc
Publié dans: Nature Ecology and Evolution, 2026, ISSN 2397-334X
Éditeur: Nature
DOI: 10.1101/2024.01.15.575685

Uncovering gene-family founder events during major evolutionary transitions in animals, plants and fungi using GenEra

Auteurs: Josué Barrera-Redondo, Jaruwatana Sodai Lotharukpong, Hajk-Georg Drost, Susana M. Coelho
Publié dans: Genome Biology, Numéro 24, 2023, ISSN 1474-760X
Éditeur: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1186/s13059-023-02895-z

Low Spontaneous Mutation Rate in Complex Multicellular Eukaryotes with a Haploid–Diploid Life Cycle

Auteurs: Marc Krasovec, Masakazu Hoshino, Min Zheng, Agnieszka P Lipinska, Susana M Coelho
Publié dans: Molecular Biology and Evolution, Numéro 40, 2023, ISSN 0737-4038
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/molbev/msad105

Cell wall‐mediated maternal control of apical–basal patterning of the kelp <i>Undaria pinnatifida</i>

Auteurs: Eloise Dries, Yannick Meyers, Daniel Liesner, Floriele M. Gonzaga, Jakob F. M. Becker, Eliane E. Zakka, Tom Beeckman, Susana M. Coelho, Olivier De Clerck, Kenny A. Bogaert
Publié dans: New Phytologist, Numéro 243, 2025, Page(s) 1887-1898, ISSN 0028-646X
Éditeur: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/nph.19953

The brown seaweed Ectocarpus

Auteurs: Susana M. Coelho
Publié dans: Nature Methods, Numéro 21, 2024, Page(s) 363-364, ISSN 1548-7091
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41592-024-02198-6

Developmental pathways underlying sexual differentiation in the U/V sex chromosome system of giant kelp

Auteurs: Daniel Liesner, Guillaume G. Cossard, Min Zheng, Olivier Godfroy, Josué Barrera-Redondo, Fabian B. Haas, Susana M. Coelho
Publié dans: Developmental Cell, Numéro 60, 2025, Page(s) 1142-1152.e6, ISSN 1534-5807
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.devcel.2024.12.022

Other (1)

THE RHODOEXPLORER PLATFORM FOR RED ALGAL GENOMICS AND WHOLE GENOME ASSEMBLIES FOR SEVERAL GRACILARIA SPECIES

Auteurs: Agnieszka P. Lipinska, Stacy A. Krueger-Hadfield, Olivier Godfroy, Simon Dittami, Lígia Ayres-Ostrock, Guido Bonthond, Loraine Brillet-Guéguen, Susana Coelho, Erwan Corre, Guillaume Cossard, Christophe Destombe, Paul Epperlein, Sylvain Faugeron, Elizabeth Ficko-Blean, Jessica Beltrán, Emma Lavaut, Arthur Le Bars, Fabiana Marchi, Stéphane Mauger, Gurvan Michel, Philippe Potin, Delphine Scornet,
Publié dans: GBE, 2026
Éditeur: springer
DOI: 10.1101/2023.03.20.533491