Reducing rumen complexity to its essential components to understand and modulate ecosystem structure and function

Informations projet

RuMinimum

N° de convention de subvention: 866530

DOI

10.3030/866530

Date de signature de la CE 23 Juin 2020

Date de début 1 Janvier 2022

Date de fin 31 Decembre 2026

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coût total

€ 2 437 500,00

Contribution de l’UE

€ 2 437 500,00

Coordonné par

BEN-GURION UNIVERSITY OF THE NEGEV
Israel

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Publications

Peer reviewed articles (11)

Cryptic diversity of cellulose-degrading gut bacteria in industrialized humans

Auteurs: Sarah Moraïs, Sarah Winkler, Alvah Zorea, Liron Levin, Falk S. P. Nagies, Nils Kapust, Eva Lamed, Avital Artan-Furman, David N. Bolam, Madhav P. Yadav, Edward A. Bayer, William F. Martin, Itzhak Mizrahi
Publié dans: Science, Numéro 383, 2024, ISSN 0036-8075
Éditeur: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/science.adj9223

Asgard ESCRT-III and VPS4 reveal conserved chromatin binding properties of the ESCRT machinery

Auteurs: Dikla Nachmias, Nataly Melnikov, Alvah Zorea, Maya Sharon, Reut Yemini, Yasmin De-picchoto, Ioannis Tsirkas, Amir Aharoni, Bela Frohn, Petra Schwille, Raz Zarivach, Itzhak Mizrahi, Natalie Elia
Publié dans: The ISME Journal, Numéro 17, 2024, Page(s) 117-129, ISSN 1751-7362
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41396-022-01328-2

Plasmids in the human gut reveal neutral dispersal and recombination that is overpowered by inflammatory diseases

Auteurs: Alvah Zorea, David Pellow, Liron Levin, Shai Pilosof, Jonathan Friedman, Ron Shamir, Itzhak Mizrahi
Publié dans: Nature Communications, Numéro 15, 2024, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-024-47272-x

The underappreciated diversity of bile acid modifications

Auteurs: Ipsita Mohanty, Helena Mannochio-Russo, Joshua V. Schweer, Yasin El Abiead, Wout Bittremieux, Shipei Xing, Robin Schmid, Simone Zuffa, Felipe Vasquez, Valentina B. Muti, Jasmine Zemlin, Omar E. Tovar-Herrera, Sarah Moraïs, Dhimant Desai, Shantu Amin, Imhoi Koo, Christoph W. Turck, Itzhak Mizrahi, Penny M. Kris-Etherton, Kristina S. Petersen, Jennifer A. Fleming, Tao Huan, Andrew D. Patterson, Dio
Publié dans: Cell, Numéro 187, 2024, Page(s) 1801-1818.e20, ISSN 0092-8674
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cell.2024.02.019

Multilayer Networks of Plasmid Genetic Similarity Reveal Potential Pathways of Gene Transmission

Auteurs: Julie Teresa Shapiro, Alvah Zorea, Aya Brown Kav, Vicente J. Ontiveros, Itzak Mizrahi, Shai Pilosof
Publié dans: ISME J, 2024, ISSN 1751-7370
Éditeur: Nature
DOI: 10.1101/2022.09.08.507140

The origin and distribution of the main oxygen sensing mechanism across metazoans

Auteurs: Bing Song, Luca David Modjewski, Nils Kapust, Itzhak Mizrahi, William F. Martin
Publié dans: Frontiers in Physiology, Numéro 13, 2022, ISSN 1664-042X
Éditeur: Frontiers Research Foundation
DOI: 10.3389/fphys.2022.977391

Metaproteome plasticity sheds light on the ecology of the rumen microbiome and its connection to host traits

Auteurs: Goor Sasson, Sarah Moraïs, Fotini Kokou , Kristina Plate, Anke Trautwein-Schult, Elie Jami , Edward A Bayer, Dörte Becher, Itzhak Mizrahi
Publié dans: ISME J, 2022, ISSN 1751-7370
Éditeur: nature portfolio
DOI: 10.1038/s41396-022-01295-8

Plasmid-encoded toxin defence mediates mutualistic microbial interactions

Auteurs: Sarah Moraïs, Michael Mazor, Omar Tovar-Herrera, Tamar Zehavi, Alvah Zorea, Morya Ifrach, David Bogumil, Alexander Brandis, Jens Walter, Natalie Elia, Eyal Gur, Itzhak Mizrahi
Publié dans: Nature Microbiology, Numéro 9, 2024, Page(s) 108-119, ISSN 2058-5276
Éditeur: Nature
DOI: 10.1038/s41564-023-01521-9

Regional processes shape the structure of rumen microbial co‐occurrence networks

Auteurs: Geut Galai, Dafna Arbel, Keren Klass, Ido Grinshpan, Itzhak Mizrahi, Shai Pilosof
Publié dans: Ecography, 2024, ISSN 0906-7590
Éditeur: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/ecog.07430

Nanoscale resolution of microbial fiber degradation in action

Auteurs: Meltem Tatli; Sarah Moraïs; Omar Eduardo Tovar-Herrera; Yannick J. Bomble; Edward A. Bayer; Ohad Medalia; Itzhak Mizrahi
Publié dans: elife, Numéro 2, 2022, ISSN 2050-084X
Éditeur: eLife Sciences Publications
DOI: 10.7554/elife.76523

Phylogenetic diversity of core rumen microbiota as described by cryo-ET

Auteurs: Benedikt H Wimmer; Sarah Moraïs; Ran Zalk; Itzhak Mizrahi; Ohad Medalia
Publié dans: microlife, Numéro 1, 2023, ISSN 2633-6693
Éditeur: Oxford academic
DOI: 10.1093/femsml/uqad010