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CORDIS - Résultats de la recherche de l’UE
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Chemical assisted enrichment of 5-carboxycytosine that also allows for DNA sequencing at single base resolution.

Description du projet

Mettre en lumière une importante modification épigénétique chez les mammifères

Les changements épigénétiques sont des changements de l’ADN qui n’affectent pas la séquence d’ADN en soi. Les plus fréquents sont l’ajout d’un groupe méthyle à l’ADN ou la modification des histones, l’ADN des protéines s’enroule pour s’adapter au noyau cellulaire. Ils s’avèrent essentiels à l’expression génétique et peuvent toucher la programmation cellulaire. Par exemple, les cellules cutanées, cérébrales et musculaires contiennent le même ADN, mais l’épigénétique détermine les gènes qui sont activés ou désactivés, décidant ainsi le destin des cellules. La déméthylation active de l’ADN est importante pour le développement embryonnaire et pour le cerveau, où la 5-carboxylcytosine (5caC) joue un rôle également. Toutefois, ses fonctions restent largement inconnues, et il s’avère difficile de l’étudier en raison de sa faible abondance. Le projet CAC-seq., financé par l’UE, met au point une nouvelle méthode puissante pour élucider la 5caC qui promet d’améliorer considérablement la compréhension de son rôle dans les résultats épigénétiques chez les mammifères.

Objectif

5-carboxycytosine (5caC) has been robustly identified in mammalian DNA. It is known that this DNA modification plays a role in epigenetic demethylation processes. If 5caC has other epigenetically relevant functions is so far unknown. Due to its low abundance it is technically challenging to study this modification in biological samples. Identification of specific readers, recognition by the RNA polymerase II elongation complex, the presence in specific genomic loci as well as changing levels during differentiation of mouse embryonic stem cells (mESCs) point towards an important biological function. A chemical tool that would clarify the role of 5caC in mammalian biology is so far missing. Since DNA modifications play a significant role in human diseases, understanding their functions offer new opportunities for novel treatment strategies. Chemical tools have advanced the field enormously in detecting and analysing newly discovered modified bases by rationally designed chemistry for specific labelling of a given modification. Chemical enrichment of DNA fragments enables mapping of the bases at 200-400 base pair resolution and has been used for a genome-wide mapping of several DNA modifications. To obtain single base resolution a separate modification specific sequencing method needs to be applied after enrichment. To avoid a multistep procedure I will develop a chemical enrichment method for 5caC that is directly coupled to single base resolution sequencing. In combination this provides a powerful chemical tool that has far reaching impact for other researchers in the field and finally enables scientific progress on 5caC.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.

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Programme(s)

Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.

Thème(s)

Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.

Régime de financement

Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.

MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)

Voir tous les projets financés dans le cadre de ce programme de financement

Appel à propositions

Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.

(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) H2020-MSCA-IF-2019

Voir tous les projets financés au titre de cet appel

Coordinateur

THE CHANCELLOR MASTERS AND SCHOLARS OF THE UNIVERSITY OF CAMBRIDGE
Contribution nette de l'UE

La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.

€ 212 933,76
Adresse
TRINITY LANE THE OLD SCHOOLS
CB2 1TN CAMBRIDGE
Royaume-Uni

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Région
East of England East Anglia Cambridgeshire CC
Type d’activité
Higher or Secondary Education Establishments
Liens
Coût total

Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.

€ 212 933,76
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