Description du projet
Caractériser le cancer du pancréas à l’échelle unicellulaire
L’adénocarcinome canalaire pancréatique (PDAC) est un cancer au pronostic qui reste sombre. Toutefois, des preuves récentes indiquent que la stratification en différents sous-types apporte un meilleur guide pour la décision de traitement. Malgré l’hétérogénéité des patients et le manque de données fiables, certains facteurs de transcription agiraient comme des moteurs de ces sous-types, et des changements dans leur expression pourraient même faciliter le changement de sous-type. Le projet PDASwITch, financé par l’UE, explorera le rôle du microenvironnement tumoral dans ce phénomène. Avec de puissantes technologies de profilage unicellulaire à haut débit, les scientifiques caractériseront la diaphonie dynamique entre les cellules cancéreuses et la manière dont elle affecte leur phénotype. L’objectif ultime consiste à convertir cliniquement les tumeurs non-répondantes en tumeurs répondantes et à améliorer les résultats pour les patients.
Objectif
"Recently discovered subtypes in pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) have potential to better guide the choice of therapy. However, this is challenged by the lack of robust data, patient heterogeneity, tumour cell plasticity, dynamic crosstalk with surrounding cells, and post-chemotherapy induced alterations. A few transcription factors may act as drivers of specific PDAC subtypes and changes in there expression through aberrant activation of super-enhancers may lead to ‘’subtype switching’’. However, the effect of the tumour-microenvironment on enhancer-driven gene expression programme to promote ‘’subtype switching’’ in pancreatic tumour cells remains largely unexplored. Hence, with this proposal I aim to provide in-depth characterization of this dynamic crosstalk combining reporter tracing through fluorescent labelling of subtype-specific transcriptional drivers of tumour cell states with powerful high throughput single-cell technologies, and super-enhancer single cell profiling which will translate to a clinical study of neoadjuvant chemotherapy with sequential tumour sample profiling. This work will ultimately provide a platform for the development of methods to precisely determine the ""phenotypic"" state of PDAC cells and aid in designing new agents to target these processes, with the ultimate goal of converting non-responder to responder tumours and improve patient outcome."
Champ scientifique
Programme(s)
Régime de financement
MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)Coordinateur
28029 Madrid
Espagne