Opis projektu
Charakterystyka raka trzustki na poziomie pojedynczych komórek
Gruczolakorak przewodowy trzustki to nowotwór o bardzo niskim wskaźniku przeżywalności. Jednakże niedawne badania wskazują, że stratyfikacja na różne podtypy stanowi lepszą metodę podejmowania decyzji dotyczących leczenia. Pomimo niejednorodności pacjentów oraz braku rzetelnych danych uważa się, że niektóre czynniki transkrypcyjne działają jako czynniki powodujące powstawanie tych podtypów, zaś zmiany w ich ekspresji mogą nawet ułatwiać zmianę podtypu. Twórcy finansowanego ze środków UE projektu PDASwITch zbadają rolę, jaką mikrośrodowisko nowotworu odgrywa w tym zjawisku. Wykorzystując potężne wysokoprzepustowe technologie profilowania na poziomie pojedynczych komórek, naukowcy opiszą wzajemne dynamiczne zależności pomiędzy komórkami nowotworowymi i zastanowią się, w jaki sposób wpływają one na ich fenotyp. Celem nadrzędnym jest kliniczna zmiana nowotworów niereagujących na leczenie w nowotwory reagujące, a także poprawa rokowań pacjentów.
Cel
"Recently discovered subtypes in pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) have potential to better guide the choice of therapy. However, this is challenged by the lack of robust data, patient heterogeneity, tumour cell plasticity, dynamic crosstalk with surrounding cells, and post-chemotherapy induced alterations. A few transcription factors may act as drivers of specific PDAC subtypes and changes in there expression through aberrant activation of super-enhancers may lead to ‘’subtype switching’’. However, the effect of the tumour-microenvironment on enhancer-driven gene expression programme to promote ‘’subtype switching’’ in pancreatic tumour cells remains largely unexplored. Hence, with this proposal I aim to provide in-depth characterization of this dynamic crosstalk combining reporter tracing through fluorescent labelling of subtype-specific transcriptional drivers of tumour cell states with powerful high throughput single-cell technologies, and super-enhancer single cell profiling which will translate to a clinical study of neoadjuvant chemotherapy with sequential tumour sample profiling. This work will ultimately provide a platform for the development of methods to precisely determine the ""phenotypic"" state of PDAC cells and aid in designing new agents to target these processes, with the ultimate goal of converting non-responder to responder tumours and improve patient outcome."
Dziedzina nauki
Słowa kluczowe
Program(-y)
Temat(-y)
System finansowania
MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)Koordynator
28029 Madrid
Hiszpania